Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cldn3Q9Z0G9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cldn3Q9Z0G9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cldn3Q9Z0G9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cldn3Q9Z0G9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cldn3Q9Z0G9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cldn3Q9Z0G9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cldn3Q9Z0G9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cldn3Q9Z0G9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cldn3Q9Z0G9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cldn3Q9Z0G9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cldn3Q9Z0G9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cldn3Q9Z0G9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cldn3Q9Z0G9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cldn3Q9Z0G9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cldn3Q9Z0G9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cldn3Q9Z0G9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Cldn3Q9Z0G9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cldn3Q9Z0G9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cldn3Q9Z0G9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cldn3Q9Z0G9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cldn3Q9Z0G9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Cldn3Q9Z0G9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cldn3Q9Z0G9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cldn3Q9Z0G9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cldn3Q9Z0G9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cldn3Q9Z0G9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cldn3Q9Z0G9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cldn3Q9Z0G9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cldn3Q9Z0G9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cldn3Q9Z0G9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cldn3Q9Z0G9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cldn3Q9Z0G9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cldn3Q9Z0G9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cldn3Q9Z0G9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cldn3Q9Z0G9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cldn3Q9Z0G9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cldn3Q9Z0G9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cldn3Q9Z0G9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cldn3Q9Z0G9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cldn3Q9Z0G9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cldn3Q9Z0G9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cldn3Q9Z0G9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cldn3Q9Z0G9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cldn3Q9Z0G9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cldn3Q9Z0G9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cldn3Q9Z0G9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cldn3Q9Z0G9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cldn3Q9Z0G9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cldn3Q9Z0G9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cldn3Q9Z0G9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cldn3Q9Z0G9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cldn3Q9Z0G9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cldn3Q9Z0G9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cldn3Q9Z0G9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cldn3Q9Z0G9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cldn3Q9Z0G9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cldn3Q9Z0G9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cldn3Q9Z0G9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cldn3Q9Z0G9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cldn3Q9Z0G9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cldn3Q9Z0G9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cldn3Q9Z0G9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cldn3Q9Z0G9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cldn3Q9Z0G9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cldn3Q9Z0G9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cldn3Q9Z0G9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cldn3Q9Z0G9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cldn3Q9Z0G9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cldn3Q9Z0G9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cldn3Q9Z0G9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cldn3Q9Z0G9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cldn3Q9Z0G9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cldn3Q9Z0G9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cldn3Q9Z0G9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cldn3Q9Z0G9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cldn3Q9Z0G9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cldn3Q9Z0G9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cldn3Q9Z0G9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Cldn3Q9Z0G9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cldn3Q9Z0G9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cldn3Q9Z0G9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cldn3Q9Z0G9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cldn3Q9Z0G9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cldn3Q9Z0G9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cldn3Q9Z0G9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cldn3Q9Z0G9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cldn3Q9Z0G9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cldn3Q9Z0G9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cldn3Q9Z0G9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cldn3Q9Z0G9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cldn3Q9Z0G9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cldn3Q9Z0G9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cldn3Q9Z0G9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cldn3Q9Z0G9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cldn3Q9Z0G9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cldn3Q9Z0G9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cldn3Q9Z0G9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cldn3Q9Z0G9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cldn3Q9Z0G9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms