Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ArcQ9WV31 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ArcQ9WV31 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ArcQ9WV31 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ArcQ9WV31 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ArcQ9WV31 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ArcQ9WV31 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ArcQ9WV31 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ArcQ9WV31 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ArcQ9WV31 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ArcQ9WV31 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ArcQ9WV31 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ArcQ9WV31 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ArcQ9WV31 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ArcQ9WV31 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ArcQ9WV31 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ArcQ9WV31 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ArcQ9WV31 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ArcQ9WV31 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ArcQ9WV31 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ArcQ9WV31 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ArcQ9WV31 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ArcQ9WV31 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ArcQ9WV31 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ArcQ9WV31 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ArcQ9WV31 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
ArcQ9WV31 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ArcQ9WV31 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ArcQ9WV31 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ArcQ9WV31 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ArcQ9WV31 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ArcQ9WV31 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ArcQ9WV31 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ArcQ9WV31 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ArcQ9WV31 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ArcQ9WV31 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ArcQ9WV31 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ArcQ9WV31 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ArcQ9WV31 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ArcQ9WV31 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ArcQ9WV31 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ArcQ9WV31 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ArcQ9WV31 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ArcQ9WV31 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ArcQ9WV31 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ArcQ9WV31 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ArcQ9WV31 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ArcQ9WV31 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ArcQ9WV31 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ArcQ9WV31 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ArcQ9WV31 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ArcQ9WV31 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ArcQ9WV31 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ArcQ9WV31 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ArcQ9WV31 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ArcQ9WV31 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ArcQ9WV31 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ArcQ9WV31 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ArcQ9WV31 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ArcQ9WV31 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ArcQ9WV31 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ArcQ9WV31 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ArcQ9WV31 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ArcQ9WV31 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ArcQ9WV31 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ArcQ9WV31 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ArcQ9WV31 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ArcQ9WV31 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ArcQ9WV31 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ArcQ9WV31 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ArcQ9WV31 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ArcQ9WV31 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ArcQ9WV31 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ArcQ9WV31 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ArcQ9WV31 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ArcQ9WV31 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ArcQ9WV31 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ArcQ9WV31 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ArcQ9WV31 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ArcQ9WV31 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ArcQ9WV31 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ArcQ9WV31 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ArcQ9WV31 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ArcQ9WV31 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ArcQ9WV31 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ArcQ9WV31 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ArcQ9WV31 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ArcQ9WV31 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ArcQ9WV31 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ArcQ9WV31 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ArcQ9WV31 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ArcQ9WV31 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ArcQ9WV31 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ArcQ9WV31 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ArcQ9WV31 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ArcQ9WV31 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ArcQ9WV31 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ArcQ9WV31 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ArcQ9WV31 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ArcQ9WV31 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms