Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lhx6Q9R1R0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lhx6Q9R1R0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lhx6Q9R1R0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lhx6Q9R1R0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lhx6Q9R1R0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Lhx6Q9R1R0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lhx6Q9R1R0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lhx6Q9R1R0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lhx6Q9R1R0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lhx6Q9R1R0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lhx6Q9R1R0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lhx6Q9R1R0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lhx6Q9R1R0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lhx6Q9R1R0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lhx6Q9R1R0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lhx6Q9R1R0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lhx6Q9R1R0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lhx6Q9R1R0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lhx6Q9R1R0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lhx6Q9R1R0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lhx6Q9R1R0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lhx6Q9R1R0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lhx6Q9R1R0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lhx6Q9R1R0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lhx6Q9R1R0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Lhx6Q9R1R0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lhx6Q9R1R0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lhx6Q9R1R0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lhx6Q9R1R0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lhx6Q9R1R0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lhx6Q9R1R0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lhx6Q9R1R0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lhx6Q9R1R0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lhx6Q9R1R0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lhx6Q9R1R0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Lhx6Q9R1R0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lhx6Q9R1R0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lhx6Q9R1R0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lhx6Q9R1R0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lhx6Q9R1R0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lhx6Q9R1R0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lhx6Q9R1R0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lhx6Q9R1R0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lhx6Q9R1R0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lhx6Q9R1R0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lhx6Q9R1R0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lhx6Q9R1R0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lhx6Q9R1R0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lhx6Q9R1R0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lhx6Q9R1R0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lhx6Q9R1R0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lhx6Q9R1R0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lhx6Q9R1R0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lhx6Q9R1R0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lhx6Q9R1R0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lhx6Q9R1R0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lhx6Q9R1R0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lhx6Q9R1R0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lhx6Q9R1R0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lhx6Q9R1R0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lhx6Q9R1R0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lhx6Q9R1R0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lhx6Q9R1R0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lhx6Q9R1R0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lhx6Q9R1R0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lhx6Q9R1R0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lhx6Q9R1R0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lhx6Q9R1R0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lhx6Q9R1R0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lhx6Q9R1R0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lhx6Q9R1R0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lhx6Q9R1R0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lhx6Q9R1R0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lhx6Q9R1R0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lhx6Q9R1R0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lhx6Q9R1R0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lhx6Q9R1R0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lhx6Q9R1R0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lhx6Q9R1R0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lhx6Q9R1R0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lhx6Q9R1R0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lhx6Q9R1R0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lhx6Q9R1R0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lhx6Q9R1R0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lhx6Q9R1R0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lhx6Q9R1R0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lhx6Q9R1R0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lhx6Q9R1R0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lhx6Q9R1R0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lhx6Q9R1R0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lhx6Q9R1R0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lhx6Q9R1R0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lhx6Q9R1R0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lhx6Q9R1R0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lhx6Q9R1R0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lhx6Q9R1R0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lhx6Q9R1R0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Lhx6Q9R1R0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lhx6Q9R1R0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms