Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ25

Vnn3, Vascular non-inflammatory molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vnn3Q9QZ25 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vnn3Q9QZ25 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vnn3Q9QZ25 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vnn3Q9QZ25 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vnn3Q9QZ25 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Vnn3Q9QZ25 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vnn3Q9QZ25 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vnn3Q9QZ25 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vnn3Q9QZ25 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vnn3Q9QZ25 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vnn3Q9QZ25 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vnn3Q9QZ25 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vnn3Q9QZ25 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vnn3Q9QZ25 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vnn3Q9QZ25 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vnn3Q9QZ25 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vnn3Q9QZ25 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vnn3Q9QZ25 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vnn3Q9QZ25 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vnn3Q9QZ25 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vnn3Q9QZ25 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vnn3Q9QZ25 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vnn3Q9QZ25 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vnn3Q9QZ25 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vnn3Q9QZ25 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vnn3Q9QZ25 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vnn3Q9QZ25 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vnn3Q9QZ25 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vnn3Q9QZ25 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vnn3Q9QZ25 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vnn3Q9QZ25 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Vnn3Q9QZ25 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vnn3Q9QZ25 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vnn3Q9QZ25 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vnn3Q9QZ25 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vnn3Q9QZ25 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vnn3Q9QZ25 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Vnn3Q9QZ25 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vnn3Q9QZ25 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vnn3Q9QZ25 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vnn3Q9QZ25 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vnn3Q9QZ25 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vnn3Q9QZ25 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vnn3Q9QZ25 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vnn3Q9QZ25 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vnn3Q9QZ25 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vnn3Q9QZ25 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vnn3Q9QZ25 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vnn3Q9QZ25 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vnn3Q9QZ25 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vnn3Q9QZ25 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Vnn3Q9QZ25 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vnn3Q9QZ25 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vnn3Q9QZ25 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vnn3Q9QZ25 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vnn3Q9QZ25 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vnn3Q9QZ25 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vnn3Q9QZ25 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vnn3Q9QZ25 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vnn3Q9QZ25 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vnn3Q9QZ25 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vnn3Q9QZ25 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vnn3Q9QZ25 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Vnn3Q9QZ25 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vnn3Q9QZ25 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vnn3Q9QZ25 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vnn3Q9QZ25 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vnn3Q9QZ25 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Vnn3Q9QZ25 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vnn3Q9QZ25 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vnn3Q9QZ25 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vnn3Q9QZ25 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Vnn3Q9QZ25 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vnn3Q9QZ25 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vnn3Q9QZ25 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vnn3Q9QZ25 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vnn3Q9QZ25 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vnn3Q9QZ25 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vnn3Q9QZ25 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vnn3Q9QZ25 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vnn3Q9QZ25 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Vnn3Q9QZ25 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vnn3Q9QZ25 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vnn3Q9QZ25 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vnn3Q9QZ25 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vnn3Q9QZ25 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vnn3Q9QZ25 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Vnn3Q9QZ25 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vnn3Q9QZ25 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vnn3Q9QZ25 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vnn3Q9QZ25 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vnn3Q9QZ25 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vnn3Q9QZ25 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vnn3Q9QZ25 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vnn3Q9QZ25 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vnn3Q9QZ25 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Vnn3Q9QZ25 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vnn3Q9QZ25 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vnn3Q9QZ25 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vnn3Q9QZ25 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms