Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE0

Hacl1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacl1Q9QXE0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Hacl1Q9QXE0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hacl1Q9QXE0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hacl1Q9QXE0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hacl1Q9QXE0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hacl1Q9QXE0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Hacl1Q9QXE0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hacl1Q9QXE0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hacl1Q9QXE0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hacl1Q9QXE0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Hacl1Q9QXE0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Hacl1Q9QXE0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hacl1Q9QXE0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hacl1Q9QXE0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hacl1Q9QXE0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hacl1Q9QXE0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Hacl1Q9QXE0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hacl1Q9QXE0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hacl1Q9QXE0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hacl1Q9QXE0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hacl1Q9QXE0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hacl1Q9QXE0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hacl1Q9QXE0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hacl1Q9QXE0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hacl1Q9QXE0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hacl1Q9QXE0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hacl1Q9QXE0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Hacl1Q9QXE0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hacl1Q9QXE0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hacl1Q9QXE0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hacl1Q9QXE0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hacl1Q9QXE0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hacl1Q9QXE0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hacl1Q9QXE0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hacl1Q9QXE0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hacl1Q9QXE0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hacl1Q9QXE0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hacl1Q9QXE0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hacl1Q9QXE0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hacl1Q9QXE0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hacl1Q9QXE0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hacl1Q9QXE0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hacl1Q9QXE0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hacl1Q9QXE0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hacl1Q9QXE0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hacl1Q9QXE0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hacl1Q9QXE0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hacl1Q9QXE0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hacl1Q9QXE0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hacl1Q9QXE0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hacl1Q9QXE0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hacl1Q9QXE0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hacl1Q9QXE0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hacl1Q9QXE0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hacl1Q9QXE0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hacl1Q9QXE0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hacl1Q9QXE0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hacl1Q9QXE0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hacl1Q9QXE0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hacl1Q9QXE0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hacl1Q9QXE0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hacl1Q9QXE0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Hacl1Q9QXE0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hacl1Q9QXE0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hacl1Q9QXE0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hacl1Q9QXE0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hacl1Q9QXE0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hacl1Q9QXE0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hacl1Q9QXE0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hacl1Q9QXE0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hacl1Q9QXE0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hacl1Q9QXE0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hacl1Q9QXE0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hacl1Q9QXE0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hacl1Q9QXE0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Hacl1Q9QXE0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hacl1Q9QXE0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hacl1Q9QXE0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hacl1Q9QXE0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hacl1Q9QXE0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hacl1Q9QXE0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hacl1Q9QXE0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hacl1Q9QXE0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hacl1Q9QXE0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hacl1Q9QXE0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hacl1Q9QXE0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hacl1Q9QXE0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hacl1Q9QXE0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hacl1Q9QXE0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hacl1Q9QXE0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hacl1Q9QXE0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hacl1Q9QXE0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Hacl1Q9QXE0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hacl1Q9QXE0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hacl1Q9QXE0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hacl1Q9QXE0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hacl1Q9QXE0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hacl1Q9QXE0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Hacl1Q9QXE0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Hacl1Q9QXE0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms