Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET54

Palld, Palladin, mousemouse

Predictions only

Length 1,408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PalldQ9ET54 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PalldQ9ET54 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PalldQ9ET54 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PalldQ9ET54 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PalldQ9ET54 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PalldQ9ET54 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PalldQ9ET54 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PalldQ9ET54 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PalldQ9ET54 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PalldQ9ET54 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PalldQ9ET54 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PalldQ9ET54 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PalldQ9ET54 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PalldQ9ET54 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PalldQ9ET54 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
PalldQ9ET54 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
PalldQ9ET54 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PalldQ9ET54 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PalldQ9ET54 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PalldQ9ET54 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PalldQ9ET54 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PalldQ9ET54 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PalldQ9ET54 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PalldQ9ET54 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PalldQ9ET54 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
PalldQ9ET54 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
PalldQ9ET54 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PalldQ9ET54 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PalldQ9ET54 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PalldQ9ET54 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
PalldQ9ET54 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
PalldQ9ET54 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PalldQ9ET54 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PalldQ9ET54 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PalldQ9ET54 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PalldQ9ET54 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PalldQ9ET54 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PalldQ9ET54 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PalldQ9ET54 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PalldQ9ET54 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PalldQ9ET54 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PalldQ9ET54 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
PalldQ9ET54 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PalldQ9ET54 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PalldQ9ET54 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PalldQ9ET54 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PalldQ9ET54 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PalldQ9ET54 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PalldQ9ET54 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
PalldQ9ET54 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PalldQ9ET54 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PalldQ9ET54 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PalldQ9ET54 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
PalldQ9ET54 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PalldQ9ET54 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PalldQ9ET54 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
PalldQ9ET54 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PalldQ9ET54 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PalldQ9ET54 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PalldQ9ET54 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PalldQ9ET54 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PalldQ9ET54 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PalldQ9ET54 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
PalldQ9ET54 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PalldQ9ET54 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PalldQ9ET54 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PalldQ9ET54 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PalldQ9ET54 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PalldQ9ET54 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PalldQ9ET54 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
PalldQ9ET54 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PalldQ9ET54 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PalldQ9ET54 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PalldQ9ET54 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PalldQ9ET54 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PalldQ9ET54 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PalldQ9ET54 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
PalldQ9ET54 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PalldQ9ET54 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PalldQ9ET54 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PalldQ9ET54 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PalldQ9ET54 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PalldQ9ET54 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
PalldQ9ET54 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PalldQ9ET54 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PalldQ9ET54 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PalldQ9ET54 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PalldQ9ET54 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PalldQ9ET54 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PalldQ9ET54 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PalldQ9ET54 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PalldQ9ET54 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PalldQ9ET54 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PalldQ9ET54 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PalldQ9ET54 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PalldQ9ET54 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PalldQ9ET54 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PalldQ9ET54 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PalldQ9ET54 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
PalldQ9ET54 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms