Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK8

Trpv4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv4Q9EPK8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpv4Q9EPK8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpv4Q9EPK8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpv4Q9EPK8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpv4Q9EPK8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpv4Q9EPK8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpv4Q9EPK8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpv4Q9EPK8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpv4Q9EPK8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpv4Q9EPK8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpv4Q9EPK8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpv4Q9EPK8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpv4Q9EPK8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpv4Q9EPK8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpv4Q9EPK8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpv4Q9EPK8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpv4Q9EPK8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpv4Q9EPK8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpv4Q9EPK8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpv4Q9EPK8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpv4Q9EPK8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Trpv4Q9EPK8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpv4Q9EPK8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpv4Q9EPK8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpv4Q9EPK8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpv4Q9EPK8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpv4Q9EPK8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpv4Q9EPK8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpv4Q9EPK8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpv4Q9EPK8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpv4Q9EPK8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpv4Q9EPK8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpv4Q9EPK8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpv4Q9EPK8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpv4Q9EPK8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpv4Q9EPK8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpv4Q9EPK8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpv4Q9EPK8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpv4Q9EPK8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpv4Q9EPK8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpv4Q9EPK8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpv4Q9EPK8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpv4Q9EPK8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpv4Q9EPK8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpv4Q9EPK8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpv4Q9EPK8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpv4Q9EPK8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpv4Q9EPK8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpv4Q9EPK8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpv4Q9EPK8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpv4Q9EPK8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpv4Q9EPK8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trpv4Q9EPK8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trpv4Q9EPK8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trpv4Q9EPK8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Trpv4Q9EPK8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpv4Q9EPK8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpv4Q9EPK8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpv4Q9EPK8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpv4Q9EPK8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpv4Q9EPK8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpv4Q9EPK8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpv4Q9EPK8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpv4Q9EPK8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpv4Q9EPK8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpv4Q9EPK8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpv4Q9EPK8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpv4Q9EPK8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpv4Q9EPK8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpv4Q9EPK8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpv4Q9EPK8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpv4Q9EPK8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpv4Q9EPK8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpv4Q9EPK8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpv4Q9EPK8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpv4Q9EPK8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpv4Q9EPK8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpv4Q9EPK8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpv4Q9EPK8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpv4Q9EPK8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpv4Q9EPK8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpv4Q9EPK8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpv4Q9EPK8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpv4Q9EPK8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpv4Q9EPK8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpv4Q9EPK8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpv4Q9EPK8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpv4Q9EPK8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpv4Q9EPK8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpv4Q9EPK8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpv4Q9EPK8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpv4Q9EPK8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpv4Q9EPK8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpv4Q9EPK8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpv4Q9EPK8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpv4Q9EPK8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpv4Q9EPK8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpv4Q9EPK8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpv4Q9EPK8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpv4Q9EPK8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms