Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ftsj3Q9DBE9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ftsj3Q9DBE9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ftsj3Q9DBE9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ftsj3Q9DBE9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ftsj3Q9DBE9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ftsj3Q9DBE9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ftsj3Q9DBE9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ftsj3Q9DBE9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ftsj3Q9DBE9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ftsj3Q9DBE9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ftsj3Q9DBE9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ftsj3Q9DBE9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ftsj3Q9DBE9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ftsj3Q9DBE9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Ftsj3Q9DBE9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ftsj3Q9DBE9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ftsj3Q9DBE9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ftsj3Q9DBE9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ftsj3Q9DBE9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ftsj3Q9DBE9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ftsj3Q9DBE9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ftsj3Q9DBE9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ftsj3Q9DBE9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Ftsj3Q9DBE9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ftsj3Q9DBE9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ftsj3Q9DBE9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ftsj3Q9DBE9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ftsj3Q9DBE9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ftsj3Q9DBE9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ftsj3Q9DBE9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ftsj3Q9DBE9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ftsj3Q9DBE9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ftsj3Q9DBE9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ftsj3Q9DBE9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ftsj3Q9DBE9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ftsj3Q9DBE9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ftsj3Q9DBE9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ftsj3Q9DBE9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ftsj3Q9DBE9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ftsj3Q9DBE9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ftsj3Q9DBE9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ftsj3Q9DBE9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ftsj3Q9DBE9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ftsj3Q9DBE9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ftsj3Q9DBE9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ftsj3Q9DBE9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ftsj3Q9DBE9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ftsj3Q9DBE9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ftsj3Q9DBE9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ftsj3Q9DBE9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ftsj3Q9DBE9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ftsj3Q9DBE9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ftsj3Q9DBE9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ftsj3Q9DBE9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ftsj3Q9DBE9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ftsj3Q9DBE9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ftsj3Q9DBE9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ftsj3Q9DBE9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ftsj3Q9DBE9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ftsj3Q9DBE9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ftsj3Q9DBE9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Ftsj3Q9DBE9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ftsj3Q9DBE9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ftsj3Q9DBE9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Ftsj3Q9DBE9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ftsj3Q9DBE9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ftsj3Q9DBE9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ftsj3Q9DBE9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ftsj3Q9DBE9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ftsj3Q9DBE9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ftsj3Q9DBE9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ftsj3Q9DBE9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ftsj3Q9DBE9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ftsj3Q9DBE9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ftsj3Q9DBE9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ftsj3Q9DBE9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ftsj3Q9DBE9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ftsj3Q9DBE9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ftsj3Q9DBE9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ftsj3Q9DBE9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ftsj3Q9DBE9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ftsj3Q9DBE9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ftsj3Q9DBE9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ftsj3Q9DBE9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ftsj3Q9DBE9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ftsj3Q9DBE9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ftsj3Q9DBE9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ftsj3Q9DBE9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ftsj3Q9DBE9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.57■■■□□ 2
Ftsj3Q9DBE9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ftsj3Q9DBE9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ftsj3Q9DBE9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ftsj3Q9DBE9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ftsj3Q9DBE9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ftsj3Q9DBE9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ftsj3Q9DBE9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ftsj3Q9DBE9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.52■■■□□ 2
Ftsj3Q9DBE9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ftsj3Q9DBE9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms