Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M0

Prss52, Serine protease 52, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss52Q9D9M0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prss52Q9D9M0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prss52Q9D9M0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prss52Q9D9M0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prss52Q9D9M0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Prss52Q9D9M0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prss52Q9D9M0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prss52Q9D9M0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prss52Q9D9M0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prss52Q9D9M0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prss52Q9D9M0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prss52Q9D9M0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prss52Q9D9M0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prss52Q9D9M0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prss52Q9D9M0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prss52Q9D9M0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prss52Q9D9M0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Prss52Q9D9M0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prss52Q9D9M0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prss52Q9D9M0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prss52Q9D9M0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prss52Q9D9M0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prss52Q9D9M0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prss52Q9D9M0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Prss52Q9D9M0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prss52Q9D9M0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prss52Q9D9M0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prss52Q9D9M0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prss52Q9D9M0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prss52Q9D9M0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prss52Q9D9M0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prss52Q9D9M0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prss52Q9D9M0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prss52Q9D9M0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Prss52Q9D9M0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prss52Q9D9M0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prss52Q9D9M0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prss52Q9D9M0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prss52Q9D9M0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prss52Q9D9M0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prss52Q9D9M0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prss52Q9D9M0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prss52Q9D9M0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prss52Q9D9M0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prss52Q9D9M0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prss52Q9D9M0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prss52Q9D9M0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prss52Q9D9M0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prss52Q9D9M0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prss52Q9D9M0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prss52Q9D9M0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prss52Q9D9M0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prss52Q9D9M0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prss52Q9D9M0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prss52Q9D9M0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prss52Q9D9M0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Prss52Q9D9M0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prss52Q9D9M0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prss52Q9D9M0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prss52Q9D9M0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prss52Q9D9M0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Prss52Q9D9M0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prss52Q9D9M0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Prss52Q9D9M0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prss52Q9D9M0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prss52Q9D9M0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prss52Q9D9M0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prss52Q9D9M0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prss52Q9D9M0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prss52Q9D9M0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prss52Q9D9M0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prss52Q9D9M0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prss52Q9D9M0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Prss52Q9D9M0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prss52Q9D9M0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prss52Q9D9M0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prss52Q9D9M0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prss52Q9D9M0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Prss52Q9D9M0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prss52Q9D9M0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prss52Q9D9M0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prss52Q9D9M0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prss52Q9D9M0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prss52Q9D9M0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prss52Q9D9M0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Prss52Q9D9M0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prss52Q9D9M0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prss52Q9D9M0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prss52Q9D9M0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prss52Q9D9M0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prss52Q9D9M0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prss52Q9D9M0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prss52Q9D9M0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prss52Q9D9M0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prss52Q9D9M0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Prss52Q9D9M0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prss52Q9D9M0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prss52Q9D9M0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prss52Q9D9M0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prss52Q9D9M0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms