Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L5

2310002L09Rik, RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310002L09RikQ9D7L5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
2310002L09RikQ9D7L5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
2310002L09RikQ9D7L5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
2310002L09RikQ9D7L5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
2310002L09RikQ9D7L5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
2310002L09RikQ9D7L5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
2310002L09RikQ9D7L5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
2310002L09RikQ9D7L5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
2310002L09RikQ9D7L5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
2310002L09RikQ9D7L5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
2310002L09RikQ9D7L5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
2310002L09RikQ9D7L5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
2310002L09RikQ9D7L5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
2310002L09RikQ9D7L5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
2310002L09RikQ9D7L5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
2310002L09RikQ9D7L5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
2310002L09RikQ9D7L5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
2310002L09RikQ9D7L5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
2310002L09RikQ9D7L5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
2310002L09RikQ9D7L5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
2310002L09RikQ9D7L5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
2310002L09RikQ9D7L5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
2310002L09RikQ9D7L5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
2310002L09RikQ9D7L5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
2310002L09RikQ9D7L5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
2310002L09RikQ9D7L5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
2310002L09RikQ9D7L5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
2310002L09RikQ9D7L5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
2310002L09RikQ9D7L5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
2310002L09RikQ9D7L5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
2310002L09RikQ9D7L5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
2310002L09RikQ9D7L5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
2310002L09RikQ9D7L5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
2310002L09RikQ9D7L5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
2310002L09RikQ9D7L5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
2310002L09RikQ9D7L5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
2310002L09RikQ9D7L5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
2310002L09RikQ9D7L5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
2310002L09RikQ9D7L5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
2310002L09RikQ9D7L5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
2310002L09RikQ9D7L5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
2310002L09RikQ9D7L5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
2310002L09RikQ9D7L5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
2310002L09RikQ9D7L5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
2310002L09RikQ9D7L5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
2310002L09RikQ9D7L5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
2310002L09RikQ9D7L5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
2310002L09RikQ9D7L5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
2310002L09RikQ9D7L5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
2310002L09RikQ9D7L5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
2310002L09RikQ9D7L5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
2310002L09RikQ9D7L5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
2310002L09RikQ9D7L5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
2310002L09RikQ9D7L5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
2310002L09RikQ9D7L5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
2310002L09RikQ9D7L5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
2310002L09RikQ9D7L5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
2310002L09RikQ9D7L5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
2310002L09RikQ9D7L5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
2310002L09RikQ9D7L5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
2310002L09RikQ9D7L5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
2310002L09RikQ9D7L5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
2310002L09RikQ9D7L5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
2310002L09RikQ9D7L5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
2310002L09RikQ9D7L5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
2310002L09RikQ9D7L5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
2310002L09RikQ9D7L5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
2310002L09RikQ9D7L5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
2310002L09RikQ9D7L5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
2310002L09RikQ9D7L5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
2310002L09RikQ9D7L5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
2310002L09RikQ9D7L5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
2310002L09RikQ9D7L5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
2310002L09RikQ9D7L5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
2310002L09RikQ9D7L5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
2310002L09RikQ9D7L5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
2310002L09RikQ9D7L5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
2310002L09RikQ9D7L5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
2310002L09RikQ9D7L5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
2310002L09RikQ9D7L5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
2310002L09RikQ9D7L5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
2310002L09RikQ9D7L5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
2310002L09RikQ9D7L5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
2310002L09RikQ9D7L5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
2310002L09RikQ9D7L5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
2310002L09RikQ9D7L5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
2310002L09RikQ9D7L5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
2310002L09RikQ9D7L5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
2310002L09RikQ9D7L5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
2310002L09RikQ9D7L5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
2310002L09RikQ9D7L5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
2310002L09RikQ9D7L5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
2310002L09RikQ9D7L5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
2310002L09RikQ9D7L5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
2310002L09RikQ9D7L5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
2310002L09RikQ9D7L5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
2310002L09RikQ9D7L5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms