Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ttc9bQ9D6E4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ttc9bQ9D6E4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ttc9bQ9D6E4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ttc9bQ9D6E4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ttc9bQ9D6E4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ttc9bQ9D6E4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ttc9bQ9D6E4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ttc9bQ9D6E4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ttc9bQ9D6E4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Ttc9bQ9D6E4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ttc9bQ9D6E4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ttc9bQ9D6E4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ttc9bQ9D6E4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ttc9bQ9D6E4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ttc9bQ9D6E4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ttc9bQ9D6E4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ttc9bQ9D6E4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ttc9bQ9D6E4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ttc9bQ9D6E4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ttc9bQ9D6E4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ttc9bQ9D6E4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ttc9bQ9D6E4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ttc9bQ9D6E4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ttc9bQ9D6E4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ttc9bQ9D6E4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ttc9bQ9D6E4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ttc9bQ9D6E4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ttc9bQ9D6E4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ttc9bQ9D6E4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ttc9bQ9D6E4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ttc9bQ9D6E4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ttc9bQ9D6E4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ttc9bQ9D6E4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ttc9bQ9D6E4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ttc9bQ9D6E4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ttc9bQ9D6E4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ttc9bQ9D6E4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ttc9bQ9D6E4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ttc9bQ9D6E4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttc9bQ9D6E4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ttc9bQ9D6E4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ttc9bQ9D6E4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ttc9bQ9D6E4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ttc9bQ9D6E4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ttc9bQ9D6E4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ttc9bQ9D6E4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ttc9bQ9D6E4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ttc9bQ9D6E4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ttc9bQ9D6E4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ttc9bQ9D6E4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ttc9bQ9D6E4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ttc9bQ9D6E4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ttc9bQ9D6E4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ttc9bQ9D6E4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ttc9bQ9D6E4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ttc9bQ9D6E4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ttc9bQ9D6E4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ttc9bQ9D6E4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ttc9bQ9D6E4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Ttc9bQ9D6E4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ttc9bQ9D6E4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ttc9bQ9D6E4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ttc9bQ9D6E4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ttc9bQ9D6E4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ttc9bQ9D6E4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ttc9bQ9D6E4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ttc9bQ9D6E4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ttc9bQ9D6E4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ttc9bQ9D6E4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ttc9bQ9D6E4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ttc9bQ9D6E4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ttc9bQ9D6E4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ttc9bQ9D6E4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ttc9bQ9D6E4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ttc9bQ9D6E4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ttc9bQ9D6E4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ttc9bQ9D6E4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ttc9bQ9D6E4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ttc9bQ9D6E4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ttc9bQ9D6E4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ttc9bQ9D6E4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ttc9bQ9D6E4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ttc9bQ9D6E4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ttc9bQ9D6E4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ttc9bQ9D6E4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ttc9bQ9D6E4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ttc9bQ9D6E4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ttc9bQ9D6E4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ttc9bQ9D6E4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ttc9bQ9D6E4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ttc9bQ9D6E4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ttc9bQ9D6E4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ttc9bQ9D6E4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ttc9bQ9D6E4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Ttc9bQ9D6E4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ttc9bQ9D6E4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ttc9bQ9D6E4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ttc9bQ9D6E4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms