Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrp2bpQ9D4C6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrp2bpQ9D4C6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrp2bpQ9D4C6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lrp2bpQ9D4C6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lrp2bpQ9D4C6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Lrp2bpQ9D4C6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Lrp2bpQ9D4C6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Lrp2bpQ9D4C6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lrp2bpQ9D4C6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lrp2bpQ9D4C6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lrp2bpQ9D4C6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lrp2bpQ9D4C6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lrp2bpQ9D4C6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrp2bpQ9D4C6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrp2bpQ9D4C6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrp2bpQ9D4C6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lrp2bpQ9D4C6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lrp2bpQ9D4C6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lrp2bpQ9D4C6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrp2bpQ9D4C6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrp2bpQ9D4C6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrp2bpQ9D4C6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrp2bpQ9D4C6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrp2bpQ9D4C6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lrp2bpQ9D4C6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lrp2bpQ9D4C6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lrp2bpQ9D4C6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lrp2bpQ9D4C6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lrp2bpQ9D4C6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lrp2bpQ9D4C6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Lrp2bpQ9D4C6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lrp2bpQ9D4C6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lrp2bpQ9D4C6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lrp2bpQ9D4C6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lrp2bpQ9D4C6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lrp2bpQ9D4C6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Lrp2bpQ9D4C6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lrp2bpQ9D4C6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lrp2bpQ9D4C6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lrp2bpQ9D4C6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lrp2bpQ9D4C6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lrp2bpQ9D4C6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lrp2bpQ9D4C6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lrp2bpQ9D4C6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Lrp2bpQ9D4C6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lrp2bpQ9D4C6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lrp2bpQ9D4C6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lrp2bpQ9D4C6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lrp2bpQ9D4C6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lrp2bpQ9D4C6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lrp2bpQ9D4C6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lrp2bpQ9D4C6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lrp2bpQ9D4C6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lrp2bpQ9D4C6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lrp2bpQ9D4C6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lrp2bpQ9D4C6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lrp2bpQ9D4C6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lrp2bpQ9D4C6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Lrp2bpQ9D4C6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lrp2bpQ9D4C6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lrp2bpQ9D4C6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lrp2bpQ9D4C6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lrp2bpQ9D4C6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lrp2bpQ9D4C6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Lrp2bpQ9D4C6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lrp2bpQ9D4C6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lrp2bpQ9D4C6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lrp2bpQ9D4C6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lrp2bpQ9D4C6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lrp2bpQ9D4C6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Lrp2bpQ9D4C6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lrp2bpQ9D4C6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lrp2bpQ9D4C6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lrp2bpQ9D4C6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lrp2bpQ9D4C6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lrp2bpQ9D4C6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lrp2bpQ9D4C6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lrp2bpQ9D4C6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lrp2bpQ9D4C6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lrp2bpQ9D4C6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lrp2bpQ9D4C6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lrp2bpQ9D4C6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lrp2bpQ9D4C6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lrp2bpQ9D4C6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lrp2bpQ9D4C6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lrp2bpQ9D4C6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lrp2bpQ9D4C6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lrp2bpQ9D4C6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Lrp2bpQ9D4C6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lrp2bpQ9D4C6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lrp2bpQ9D4C6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lrp2bpQ9D4C6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lrp2bpQ9D4C6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lrp2bpQ9D4C6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms