Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Krtap5-3Q9D226 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Krtap5-3Q9D226 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Krtap5-3Q9D226 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Krtap5-3Q9D226 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Krtap5-3Q9D226 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Krtap5-3Q9D226 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Krtap5-3Q9D226 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Krtap5-3Q9D226 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Krtap5-3Q9D226 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Krtap5-3Q9D226 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Krtap5-3Q9D226 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Krtap5-3Q9D226 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Krtap5-3Q9D226 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Krtap5-3Q9D226 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Krtap5-3Q9D226 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Krtap5-3Q9D226 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Krtap5-3Q9D226 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Krtap5-3Q9D226 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Krtap5-3Q9D226 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Krtap5-3Q9D226 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Krtap5-3Q9D226 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Krtap5-3Q9D226 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Krtap5-3Q9D226 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Krtap5-3Q9D226 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Krtap5-3Q9D226 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Krtap5-3Q9D226 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Krtap5-3Q9D226 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Krtap5-3Q9D226 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Krtap5-3Q9D226 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Krtap5-3Q9D226 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Krtap5-3Q9D226 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Krtap5-3Q9D226 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Krtap5-3Q9D226 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Krtap5-3Q9D226 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Krtap5-3Q9D226 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Krtap5-3Q9D226 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Krtap5-3Q9D226 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Krtap5-3Q9D226 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Krtap5-3Q9D226 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Krtap5-3Q9D226 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Krtap5-3Q9D226 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Krtap5-3Q9D226 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Krtap5-3Q9D226 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Krtap5-3Q9D226 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Krtap5-3Q9D226 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Krtap5-3Q9D226 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Krtap5-3Q9D226 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Krtap5-3Q9D226 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Krtap5-3Q9D226 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Krtap5-3Q9D226 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Krtap5-3Q9D226 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Krtap5-3Q9D226 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Krtap5-3Q9D226 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Krtap5-3Q9D226 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Krtap5-3Q9D226 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Krtap5-3Q9D226 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Krtap5-3Q9D226 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Krtap5-3Q9D226 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Krtap5-3Q9D226 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Krtap5-3Q9D226 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Krtap5-3Q9D226 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Krtap5-3Q9D226 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Krtap5-3Q9D226 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Krtap5-3Q9D226 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Krtap5-3Q9D226 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Krtap5-3Q9D226 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Krtap5-3Q9D226 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Krtap5-3Q9D226 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Krtap5-3Q9D226 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Krtap5-3Q9D226 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Krtap5-3Q9D226 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Krtap5-3Q9D226 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Krtap5-3Q9D226 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Krtap5-3Q9D226 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Krtap5-3Q9D226 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Krtap5-3Q9D226 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Krtap5-3Q9D226 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Krtap5-3Q9D226 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Krtap5-3Q9D226 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Krtap5-3Q9D226 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Krtap5-3Q9D226 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Krtap5-3Q9D226 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Krtap5-3Q9D226 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Krtap5-3Q9D226 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Krtap5-3Q9D226 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Krtap5-3Q9D226 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Krtap5-3Q9D226 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Krtap5-3Q9D226 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Krtap5-3Q9D226 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Krtap5-3Q9D226 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Krtap5-3Q9D226 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Krtap5-3Q9D226 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Krtap5-3Q9D226 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Krtap5-3Q9D226 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Krtap5-3Q9D226 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Krtap5-3Q9D226 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Krtap5-3Q9D226 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Krtap5-3Q9D226 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Krtap5-3Q9D226 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms