Protein–RNA interactions for Protein: Q9D110

Mthfs, 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MthfsQ9D110 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
MthfsQ9D110 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MthfsQ9D110 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MthfsQ9D110 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MthfsQ9D110 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MthfsQ9D110 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MthfsQ9D110 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MthfsQ9D110 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MthfsQ9D110 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MthfsQ9D110 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MthfsQ9D110 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MthfsQ9D110 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MthfsQ9D110 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MthfsQ9D110 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
MthfsQ9D110 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
MthfsQ9D110 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
MthfsQ9D110 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MthfsQ9D110 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
MthfsQ9D110 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
MthfsQ9D110 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MthfsQ9D110 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MthfsQ9D110 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MthfsQ9D110 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MthfsQ9D110 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MthfsQ9D110 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MthfsQ9D110 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MthfsQ9D110 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MthfsQ9D110 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MthfsQ9D110 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MthfsQ9D110 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MthfsQ9D110 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MthfsQ9D110 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MthfsQ9D110 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MthfsQ9D110 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MthfsQ9D110 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MthfsQ9D110 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MthfsQ9D110 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MthfsQ9D110 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MthfsQ9D110 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MthfsQ9D110 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MthfsQ9D110 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MthfsQ9D110 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MthfsQ9D110 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
MthfsQ9D110 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MthfsQ9D110 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MthfsQ9D110 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MthfsQ9D110 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MthfsQ9D110 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MthfsQ9D110 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MthfsQ9D110 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MthfsQ9D110 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MthfsQ9D110 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MthfsQ9D110 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MthfsQ9D110 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MthfsQ9D110 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
MthfsQ9D110 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
MthfsQ9D110 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
MthfsQ9D110 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MthfsQ9D110 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MthfsQ9D110 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MthfsQ9D110 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MthfsQ9D110 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MthfsQ9D110 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MthfsQ9D110 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
MthfsQ9D110 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MthfsQ9D110 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MthfsQ9D110 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MthfsQ9D110 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MthfsQ9D110 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MthfsQ9D110 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MthfsQ9D110 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MthfsQ9D110 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MthfsQ9D110 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MthfsQ9D110 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MthfsQ9D110 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MthfsQ9D110 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MthfsQ9D110 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MthfsQ9D110 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MthfsQ9D110 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MthfsQ9D110 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MthfsQ9D110 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
MthfsQ9D110 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MthfsQ9D110 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MthfsQ9D110 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MthfsQ9D110 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MthfsQ9D110 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MthfsQ9D110 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MthfsQ9D110 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MthfsQ9D110 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
MthfsQ9D110 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MthfsQ9D110 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MthfsQ9D110 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MthfsQ9D110 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MthfsQ9D110 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
MthfsQ9D110 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MthfsQ9D110 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MthfsQ9D110 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MthfsQ9D110 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
MthfsQ9D110 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MthfsQ9D110 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms