Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bud23Q9CY21 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bud23Q9CY21 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bud23Q9CY21 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bud23Q9CY21 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bud23Q9CY21 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bud23Q9CY21 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Bud23Q9CY21 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bud23Q9CY21 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bud23Q9CY21 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bud23Q9CY21 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bud23Q9CY21 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bud23Q9CY21 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bud23Q9CY21 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bud23Q9CY21 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bud23Q9CY21 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Bud23Q9CY21 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bud23Q9CY21 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Bud23Q9CY21 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bud23Q9CY21 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bud23Q9CY21 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bud23Q9CY21 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bud23Q9CY21 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Bud23Q9CY21 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bud23Q9CY21 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Bud23Q9CY21 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bud23Q9CY21 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Bud23Q9CY21 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bud23Q9CY21 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bud23Q9CY21 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bud23Q9CY21 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bud23Q9CY21 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bud23Q9CY21 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bud23Q9CY21 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Bud23Q9CY21 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bud23Q9CY21 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bud23Q9CY21 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bud23Q9CY21 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bud23Q9CY21 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bud23Q9CY21 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bud23Q9CY21 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bud23Q9CY21 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bud23Q9CY21 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bud23Q9CY21 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bud23Q9CY21 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Bud23Q9CY21 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Bud23Q9CY21 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Bud23Q9CY21 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bud23Q9CY21 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bud23Q9CY21 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bud23Q9CY21 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bud23Q9CY21 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bud23Q9CY21 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bud23Q9CY21 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Bud23Q9CY21 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bud23Q9CY21 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bud23Q9CY21 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Bud23Q9CY21 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bud23Q9CY21 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bud23Q9CY21 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bud23Q9CY21 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Bud23Q9CY21 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Bud23Q9CY21 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Bud23Q9CY21 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bud23Q9CY21 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bud23Q9CY21 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bud23Q9CY21 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bud23Q9CY21 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bud23Q9CY21 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bud23Q9CY21 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bud23Q9CY21 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bud23Q9CY21 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bud23Q9CY21 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Bud23Q9CY21 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bud23Q9CY21 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bud23Q9CY21 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bud23Q9CY21 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bud23Q9CY21 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bud23Q9CY21 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bud23Q9CY21 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bud23Q9CY21 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bud23Q9CY21 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bud23Q9CY21 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bud23Q9CY21 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bud23Q9CY21 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bud23Q9CY21 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bud23Q9CY21 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bud23Q9CY21 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bud23Q9CY21 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Bud23Q9CY21 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bud23Q9CY21 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bud23Q9CY21 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bud23Q9CY21 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Bud23Q9CY21 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bud23Q9CY21 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bud23Q9CY21 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bud23Q9CY21 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Bud23Q9CY21 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bud23Q9CY21 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bud23Q9CY21 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms