Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
Bud23Q9CY21 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Bud23Q9CY21 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Bud23Q9CY21 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Bud23Q9CY21 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Bud23Q9CY21 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
Bud23Q9CY21 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Bud23Q9CY21 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Bud23Q9CY21 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Bud23Q9CY21 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Bud23Q9CY21 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Bud23Q9CY21 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Bud23Q9CY21 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Bud23Q9CY21 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Bud23Q9CY21 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Bud23Q9CY21 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Bud23Q9CY21 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Bud23Q9CY21 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Bud23Q9CY21 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Bud23Q9CY21 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Bud23Q9CY21 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Bud23Q9CY21 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Bud23Q9CY21 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Bud23Q9CY21 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Bud23Q9CY21 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Bud23Q9CY21 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Bud23Q9CY21 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Bud23Q9CY21 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Bud23Q9CY21 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Bud23Q9CY21 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Bud23Q9CY21 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Bud23Q9CY21 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Bud23Q9CY21 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Bud23Q9CY21 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Bud23Q9CY21 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Bud23Q9CY21 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Bud23Q9CY21 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Bud23Q9CY21 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Bud23Q9CY21 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Bud23Q9CY21 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Bud23Q9CY21 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Bud23Q9CY21 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Bud23Q9CY21 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Bud23Q9CY21 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Bud23Q9CY21 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Bud23Q9CY21 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Bud23Q9CY21 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Bud23Q9CY21 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Bud23Q9CY21 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Bud23Q9CY21 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Bud23Q9CY21 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Bud23Q9CY21 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Bud23Q9CY21 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Bud23Q9CY21 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Bud23Q9CY21 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Bud23Q9CY21 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Bud23Q9CY21 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Bud23Q9CY21 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Bud23Q9CY21 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Bud23Q9CY21 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Bud23Q9CY21 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Bud23Q9CY21 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Bud23Q9CY21 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Bud23Q9CY21 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Bud23Q9CY21 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Bud23Q9CY21 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Bud23Q9CY21 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Bud23Q9CY21 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Bud23Q9CY21 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Bud23Q9CY21 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Bud23Q9CY21 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Bud23Q9CY21 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Bud23Q9CY21 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Bud23Q9CY21 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Bud23Q9CY21 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Bud23Q9CY21 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Bud23Q9CY21 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Bud23Q9CY21 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Bud23Q9CY21 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Bud23Q9CY21 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Bud23Q9CY21 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Bud23Q9CY21 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Bud23Q9CY21 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Bud23Q9CY21 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Bud23Q9CY21 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Bud23Q9CY21 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Bud23Q9CY21 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Bud23Q9CY21 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Bud23Q9CY21 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Bud23Q9CY21 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Bud23Q9CY21 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Bud23Q9CY21 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Bud23Q9CY21 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Bud23Q9CY21 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Bud23Q9CY21 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Bud23Q9CY21 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Bud23Q9CY21 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Bud23Q9CY21 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Bud23Q9CY21 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Bud23Q9CY21 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.5 ms