Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Otud1Q9CUB6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Otud1Q9CUB6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Otud1Q9CUB6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Otud1Q9CUB6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Otud1Q9CUB6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Otud1Q9CUB6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Otud1Q9CUB6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Otud1Q9CUB6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Otud1Q9CUB6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Otud1Q9CUB6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Otud1Q9CUB6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Otud1Q9CUB6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Otud1Q9CUB6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Otud1Q9CUB6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Otud1Q9CUB6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Otud1Q9CUB6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Otud1Q9CUB6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Otud1Q9CUB6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Otud1Q9CUB6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Otud1Q9CUB6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Otud1Q9CUB6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Otud1Q9CUB6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Otud1Q9CUB6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Otud1Q9CUB6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Otud1Q9CUB6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Otud1Q9CUB6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Otud1Q9CUB6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Otud1Q9CUB6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Otud1Q9CUB6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Otud1Q9CUB6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Otud1Q9CUB6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Otud1Q9CUB6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Otud1Q9CUB6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Otud1Q9CUB6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Otud1Q9CUB6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Otud1Q9CUB6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Otud1Q9CUB6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Otud1Q9CUB6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Otud1Q9CUB6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Otud1Q9CUB6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Otud1Q9CUB6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Otud1Q9CUB6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Otud1Q9CUB6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Otud1Q9CUB6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Otud1Q9CUB6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Otud1Q9CUB6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Otud1Q9CUB6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Otud1Q9CUB6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Otud1Q9CUB6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Otud1Q9CUB6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Otud1Q9CUB6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Otud1Q9CUB6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Otud1Q9CUB6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Otud1Q9CUB6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Otud1Q9CUB6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Otud1Q9CUB6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Otud1Q9CUB6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Otud1Q9CUB6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Otud1Q9CUB6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Otud1Q9CUB6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Otud1Q9CUB6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Otud1Q9CUB6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Otud1Q9CUB6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Otud1Q9CUB6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Otud1Q9CUB6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Otud1Q9CUB6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Otud1Q9CUB6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Otud1Q9CUB6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Otud1Q9CUB6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Otud1Q9CUB6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Otud1Q9CUB6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Otud1Q9CUB6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Otud1Q9CUB6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Otud1Q9CUB6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Otud1Q9CUB6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Otud1Q9CUB6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Otud1Q9CUB6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Otud1Q9CUB6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Otud1Q9CUB6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Otud1Q9CUB6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Otud1Q9CUB6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Otud1Q9CUB6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Otud1Q9CUB6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Otud1Q9CUB6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Otud1Q9CUB6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Otud1Q9CUB6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Otud1Q9CUB6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Otud1Q9CUB6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Otud1Q9CUB6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Otud1Q9CUB6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Otud1Q9CUB6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Otud1Q9CUB6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Otud1Q9CUB6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Otud1Q9CUB6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Otud1Q9CUB6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Otud1Q9CUB6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Otud1Q9CUB6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Otud1Q9CUB6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Otud1Q9CUB6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms