Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR1

Rwdd4, RWD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd4Q9CPR1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rwdd4Q9CPR1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rwdd4Q9CPR1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rwdd4Q9CPR1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rwdd4Q9CPR1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rwdd4Q9CPR1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rwdd4Q9CPR1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rwdd4Q9CPR1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rwdd4Q9CPR1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rwdd4Q9CPR1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rwdd4Q9CPR1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rwdd4Q9CPR1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rwdd4Q9CPR1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rwdd4Q9CPR1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rwdd4Q9CPR1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Rwdd4Q9CPR1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rwdd4Q9CPR1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rwdd4Q9CPR1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rwdd4Q9CPR1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rwdd4Q9CPR1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rwdd4Q9CPR1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rwdd4Q9CPR1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rwdd4Q9CPR1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rwdd4Q9CPR1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rwdd4Q9CPR1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rwdd4Q9CPR1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rwdd4Q9CPR1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rwdd4Q9CPR1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rwdd4Q9CPR1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rwdd4Q9CPR1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rwdd4Q9CPR1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rwdd4Q9CPR1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rwdd4Q9CPR1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rwdd4Q9CPR1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rwdd4Q9CPR1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rwdd4Q9CPR1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rwdd4Q9CPR1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rwdd4Q9CPR1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rwdd4Q9CPR1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rwdd4Q9CPR1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rwdd4Q9CPR1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rwdd4Q9CPR1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rwdd4Q9CPR1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rwdd4Q9CPR1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rwdd4Q9CPR1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rwdd4Q9CPR1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rwdd4Q9CPR1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rwdd4Q9CPR1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Rwdd4Q9CPR1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rwdd4Q9CPR1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rwdd4Q9CPR1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rwdd4Q9CPR1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rwdd4Q9CPR1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rwdd4Q9CPR1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rwdd4Q9CPR1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rwdd4Q9CPR1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rwdd4Q9CPR1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rwdd4Q9CPR1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rwdd4Q9CPR1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rwdd4Q9CPR1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rwdd4Q9CPR1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rwdd4Q9CPR1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rwdd4Q9CPR1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rwdd4Q9CPR1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rwdd4Q9CPR1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rwdd4Q9CPR1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rwdd4Q9CPR1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rwdd4Q9CPR1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rwdd4Q9CPR1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Rwdd4Q9CPR1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rwdd4Q9CPR1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Rwdd4Q9CPR1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rwdd4Q9CPR1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rwdd4Q9CPR1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rwdd4Q9CPR1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rwdd4Q9CPR1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rwdd4Q9CPR1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rwdd4Q9CPR1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rwdd4Q9CPR1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rwdd4Q9CPR1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rwdd4Q9CPR1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rwdd4Q9CPR1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rwdd4Q9CPR1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rwdd4Q9CPR1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rwdd4Q9CPR1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rwdd4Q9CPR1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rwdd4Q9CPR1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rwdd4Q9CPR1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rwdd4Q9CPR1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rwdd4Q9CPR1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rwdd4Q9CPR1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rwdd4Q9CPR1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rwdd4Q9CPR1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rwdd4Q9CPR1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rwdd4Q9CPR1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rwdd4Q9CPR1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rwdd4Q9CPR1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rwdd4Q9CPR1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rwdd4Q9CPR1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rwdd4Q9CPR1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms