Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
PtprtQ99M80 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
PtprtQ99M80 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
PtprtQ99M80 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
PtprtQ99M80 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
PtprtQ99M80 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
PtprtQ99M80 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
PtprtQ99M80 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.86■■■■□ 3.97
PtprtQ99M80 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
PtprtQ99M80 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
PtprtQ99M80 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
PtprtQ99M80 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC39.8■■■■□ 3.96
PtprtQ99M80 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC39.79■■■■□ 3.96
PtprtQ99M80 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
PtprtQ99M80 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
PtprtQ99M80 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
PtprtQ99M80 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC39.75■■■■□ 3.95
PtprtQ99M80 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
PtprtQ99M80 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
PtprtQ99M80 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
PtprtQ99M80 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC39.74■■■■□ 3.95
PtprtQ99M80 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
PtprtQ99M80 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
PtprtQ99M80 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
PtprtQ99M80 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
PtprtQ99M80 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
PtprtQ99M80 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
PtprtQ99M80 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
PtprtQ99M80 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC39.62■■■■□ 3.93
PtprtQ99M80 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
PtprtQ99M80 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC39.62■■■■□ 3.93
PtprtQ99M80 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
PtprtQ99M80 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC39.6■■■■□ 3.93
PtprtQ99M80 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
PtprtQ99M80 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC39.56■■■■□ 3.92
PtprtQ99M80 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
PtprtQ99M80 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
PtprtQ99M80 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
PtprtQ99M80 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
PtprtQ99M80 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
PtprtQ99M80 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
PtprtQ99M80 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC39.5■■■■□ 3.91
PtprtQ99M80 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
PtprtQ99M80 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
PtprtQ99M80 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
PtprtQ99M80 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
PtprtQ99M80 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC39.48■■■■□ 3.91
PtprtQ99M80 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
PtprtQ99M80 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
PtprtQ99M80 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
PtprtQ99M80 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
PtprtQ99M80 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
PtprtQ99M80 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
PtprtQ99M80 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
PtprtQ99M80 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
PtprtQ99M80 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
PtprtQ99M80 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
PtprtQ99M80 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
PtprtQ99M80 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
PtprtQ99M80 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
PtprtQ99M80 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
PtprtQ99M80 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
PtprtQ99M80 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
PtprtQ99M80 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
PtprtQ99M80 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
PtprtQ99M80 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
PtprtQ99M80 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
PtprtQ99M80 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
PtprtQ99M80 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
PtprtQ99M80 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
PtprtQ99M80 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
PtprtQ99M80 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
PtprtQ99M80 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC39.32■■■■□ 3.89
PtprtQ99M80 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC39.31■■■■□ 3.88
PtprtQ99M80 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
PtprtQ99M80 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
PtprtQ99M80 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
PtprtQ99M80 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
PtprtQ99M80 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC39.26■■■■□ 3.88
PtprtQ99M80 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
PtprtQ99M80 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
PtprtQ99M80 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
PtprtQ99M80 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
PtprtQ99M80 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
PtprtQ99M80 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
PtprtQ99M80 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC39.21■■■■□ 3.87
PtprtQ99M80 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
PtprtQ99M80 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
PtprtQ99M80 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
PtprtQ99M80 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
PtprtQ99M80 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
PtprtQ99M80 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
PtprtQ99M80 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
PtprtQ99M80 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC39.17■■■■□ 3.86
PtprtQ99M80 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
PtprtQ99M80 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
PtprtQ99M80 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
PtprtQ99M80 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
PtprtQ99M80 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
PtprtQ99M80 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
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