Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TriobpQ99KW3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TriobpQ99KW3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TriobpQ99KW3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TriobpQ99KW3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TriobpQ99KW3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TriobpQ99KW3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TriobpQ99KW3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TriobpQ99KW3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TriobpQ99KW3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TriobpQ99KW3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TriobpQ99KW3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TriobpQ99KW3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TriobpQ99KW3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TriobpQ99KW3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TriobpQ99KW3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TriobpQ99KW3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TriobpQ99KW3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TriobpQ99KW3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TriobpQ99KW3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TriobpQ99KW3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TriobpQ99KW3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TriobpQ99KW3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TriobpQ99KW3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TriobpQ99KW3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TriobpQ99KW3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TriobpQ99KW3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TriobpQ99KW3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TriobpQ99KW3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TriobpQ99KW3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TriobpQ99KW3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TriobpQ99KW3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TriobpQ99KW3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TriobpQ99KW3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TriobpQ99KW3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TriobpQ99KW3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TriobpQ99KW3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TriobpQ99KW3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TriobpQ99KW3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TriobpQ99KW3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TriobpQ99KW3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TriobpQ99KW3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TriobpQ99KW3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TriobpQ99KW3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TriobpQ99KW3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TriobpQ99KW3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TriobpQ99KW3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TriobpQ99KW3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TriobpQ99KW3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TriobpQ99KW3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TriobpQ99KW3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TriobpQ99KW3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TriobpQ99KW3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TriobpQ99KW3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TriobpQ99KW3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TriobpQ99KW3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TriobpQ99KW3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TriobpQ99KW3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TriobpQ99KW3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TriobpQ99KW3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TriobpQ99KW3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TriobpQ99KW3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TriobpQ99KW3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TriobpQ99KW3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TriobpQ99KW3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TriobpQ99KW3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TriobpQ99KW3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TriobpQ99KW3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TriobpQ99KW3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TriobpQ99KW3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TriobpQ99KW3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TriobpQ99KW3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TriobpQ99KW3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TriobpQ99KW3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TriobpQ99KW3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TriobpQ99KW3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TriobpQ99KW3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TriobpQ99KW3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TriobpQ99KW3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TriobpQ99KW3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TriobpQ99KW3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TriobpQ99KW3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TriobpQ99KW3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TriobpQ99KW3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TriobpQ99KW3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TriobpQ99KW3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TriobpQ99KW3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TriobpQ99KW3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TriobpQ99KW3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TriobpQ99KW3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TriobpQ99KW3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TriobpQ99KW3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TriobpQ99KW3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TriobpQ99KW3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TriobpQ99KW3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TriobpQ99KW3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TriobpQ99KW3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TriobpQ99KW3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TriobpQ99KW3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TriobpQ99KW3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.3 ms