Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Tspan1Q99J59 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tspan1Q99J59 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tspan1Q99J59 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tspan1Q99J59 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tspan1Q99J59 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tspan1Q99J59 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tspan1Q99J59 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tspan1Q99J59 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tspan1Q99J59 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tspan1Q99J59 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tspan1Q99J59 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tspan1Q99J59 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tspan1Q99J59 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tspan1Q99J59 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tspan1Q99J59 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tspan1Q99J59 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tspan1Q99J59 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tspan1Q99J59 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tspan1Q99J59 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tspan1Q99J59 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tspan1Q99J59 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tspan1Q99J59 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tspan1Q99J59 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tspan1Q99J59 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tspan1Q99J59 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tspan1Q99J59 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tspan1Q99J59 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tspan1Q99J59 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tspan1Q99J59 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tspan1Q99J59 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tspan1Q99J59 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tspan1Q99J59 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tspan1Q99J59 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Tspan1Q99J59 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tspan1Q99J59 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tspan1Q99J59 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tspan1Q99J59 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tspan1Q99J59 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tspan1Q99J59 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tspan1Q99J59 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tspan1Q99J59 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tspan1Q99J59 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tspan1Q99J59 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Tspan1Q99J59 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tspan1Q99J59 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tspan1Q99J59 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tspan1Q99J59 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tspan1Q99J59 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tspan1Q99J59 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tspan1Q99J59 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tspan1Q99J59 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tspan1Q99J59 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tspan1Q99J59 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tspan1Q99J59 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tspan1Q99J59 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tspan1Q99J59 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tspan1Q99J59 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tspan1Q99J59 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Tspan1Q99J59 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tspan1Q99J59 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tspan1Q99J59 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tspan1Q99J59 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tspan1Q99J59 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Tspan1Q99J59 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tspan1Q99J59 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tspan1Q99J59 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tspan1Q99J59 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tspan1Q99J59 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tspan1Q99J59 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tspan1Q99J59 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tspan1Q99J59 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tspan1Q99J59 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tspan1Q99J59 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tspan1Q99J59 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tspan1Q99J59 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tspan1Q99J59 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tspan1Q99J59 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tspan1Q99J59 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tspan1Q99J59 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tspan1Q99J59 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tspan1Q99J59 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tspan1Q99J59 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tspan1Q99J59 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tspan1Q99J59 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tspan1Q99J59 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tspan1Q99J59 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tspan1Q99J59 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tspan1Q99J59 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tspan1Q99J59 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tspan1Q99J59 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tspan1Q99J59 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tspan1Q99J59 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tspan1Q99J59 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tspan1Q99J59 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tspan1Q99J59 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tspan1Q99J59 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tspan1Q99J59 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tspan1Q99J59 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tspan1Q99J59 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms