Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ophn1Q99J31 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ophn1Q99J31 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ophn1Q99J31 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ophn1Q99J31 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ophn1Q99J31 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ophn1Q99J31 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ophn1Q99J31 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ophn1Q99J31 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ophn1Q99J31 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ophn1Q99J31 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ophn1Q99J31 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ophn1Q99J31 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ophn1Q99J31 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ophn1Q99J31 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ophn1Q99J31 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ophn1Q99J31 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ophn1Q99J31 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ophn1Q99J31 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ophn1Q99J31 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ophn1Q99J31 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ophn1Q99J31 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ophn1Q99J31 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ophn1Q99J31 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ophn1Q99J31 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ophn1Q99J31 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ophn1Q99J31 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ophn1Q99J31 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ophn1Q99J31 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ophn1Q99J31 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ophn1Q99J31 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ophn1Q99J31 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ophn1Q99J31 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ophn1Q99J31 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ophn1Q99J31 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ophn1Q99J31 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ophn1Q99J31 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ophn1Q99J31 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ophn1Q99J31 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ophn1Q99J31 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ophn1Q99J31 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ophn1Q99J31 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ophn1Q99J31 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ophn1Q99J31 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ophn1Q99J31 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ophn1Q99J31 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ophn1Q99J31 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ophn1Q99J31 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ophn1Q99J31 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ophn1Q99J31 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ophn1Q99J31 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ophn1Q99J31 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ophn1Q99J31 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ophn1Q99J31 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ophn1Q99J31 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ophn1Q99J31 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ophn1Q99J31 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ophn1Q99J31 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ophn1Q99J31 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ophn1Q99J31 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ophn1Q99J31 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ophn1Q99J31 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ophn1Q99J31 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ophn1Q99J31 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ophn1Q99J31 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ophn1Q99J31 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ophn1Q99J31 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ophn1Q99J31 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ophn1Q99J31 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ophn1Q99J31 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ophn1Q99J31 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ophn1Q99J31 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ophn1Q99J31 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ophn1Q99J31 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ophn1Q99J31 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ophn1Q99J31 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ophn1Q99J31 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ophn1Q99J31 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ophn1Q99J31 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ophn1Q99J31 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ophn1Q99J31 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ophn1Q99J31 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ophn1Q99J31 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ophn1Q99J31 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ophn1Q99J31 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ophn1Q99J31 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ophn1Q99J31 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ophn1Q99J31 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ophn1Q99J31 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ophn1Q99J31 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ophn1Q99J31 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ophn1Q99J31 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ophn1Q99J31 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ophn1Q99J31 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ophn1Q99J31 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ophn1Q99J31 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ophn1Q99J31 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ophn1Q99J31 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ophn1Q99J31 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ophn1Q99J31 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms