Protein–RNA interactions for Protein: Q99J21

Mcoln1, Mucolipin-1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcoln1Q99J21 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mcoln1Q99J21 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mcoln1Q99J21 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mcoln1Q99J21 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mcoln1Q99J21 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Mcoln1Q99J21 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Mcoln1Q99J21 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mcoln1Q99J21 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mcoln1Q99J21 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mcoln1Q99J21 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mcoln1Q99J21 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Mcoln1Q99J21 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Mcoln1Q99J21 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Mcoln1Q99J21 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Mcoln1Q99J21 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mcoln1Q99J21 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mcoln1Q99J21 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mcoln1Q99J21 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mcoln1Q99J21 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mcoln1Q99J21 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Mcoln1Q99J21 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mcoln1Q99J21 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mcoln1Q99J21 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mcoln1Q99J21 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mcoln1Q99J21 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mcoln1Q99J21 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mcoln1Q99J21 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mcoln1Q99J21 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mcoln1Q99J21 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mcoln1Q99J21 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Mcoln1Q99J21 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Mcoln1Q99J21 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Mcoln1Q99J21 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mcoln1Q99J21 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mcoln1Q99J21 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mcoln1Q99J21 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mcoln1Q99J21 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mcoln1Q99J21 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mcoln1Q99J21 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mcoln1Q99J21 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mcoln1Q99J21 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Mcoln1Q99J21 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Mcoln1Q99J21 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Mcoln1Q99J21 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mcoln1Q99J21 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Mcoln1Q99J21 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mcoln1Q99J21 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Mcoln1Q99J21 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mcoln1Q99J21 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mcoln1Q99J21 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mcoln1Q99J21 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mcoln1Q99J21 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mcoln1Q99J21 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Mcoln1Q99J21 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mcoln1Q99J21 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mcoln1Q99J21 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mcoln1Q99J21 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Mcoln1Q99J21 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mcoln1Q99J21 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mcoln1Q99J21 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Mcoln1Q99J21 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Mcoln1Q99J21 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Mcoln1Q99J21 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Mcoln1Q99J21 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Mcoln1Q99J21 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mcoln1Q99J21 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mcoln1Q99J21 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mcoln1Q99J21 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mcoln1Q99J21 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mcoln1Q99J21 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mcoln1Q99J21 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mcoln1Q99J21 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mcoln1Q99J21 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mcoln1Q99J21 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mcoln1Q99J21 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mcoln1Q99J21 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mcoln1Q99J21 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Mcoln1Q99J21 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Mcoln1Q99J21 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Mcoln1Q99J21 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Mcoln1Q99J21 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mcoln1Q99J21 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mcoln1Q99J21 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mcoln1Q99J21 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mcoln1Q99J21 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mcoln1Q99J21 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mcoln1Q99J21 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Mcoln1Q99J21 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Mcoln1Q99J21 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mcoln1Q99J21 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mcoln1Q99J21 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mcoln1Q99J21 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mcoln1Q99J21 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mcoln1Q99J21 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mcoln1Q99J21 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mcoln1Q99J21 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mcoln1Q99J21 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Mcoln1Q99J21 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Mcoln1Q99J21 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Mcoln1Q99J21 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms