Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TardbpQ921F2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TardbpQ921F2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TardbpQ921F2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TardbpQ921F2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TardbpQ921F2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TardbpQ921F2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TardbpQ921F2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TardbpQ921F2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TardbpQ921F2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TardbpQ921F2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TardbpQ921F2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TardbpQ921F2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TardbpQ921F2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TardbpQ921F2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TardbpQ921F2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TardbpQ921F2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TardbpQ921F2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TardbpQ921F2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TardbpQ921F2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TardbpQ921F2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TardbpQ921F2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TardbpQ921F2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TardbpQ921F2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TardbpQ921F2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TardbpQ921F2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TardbpQ921F2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TardbpQ921F2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TardbpQ921F2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TardbpQ921F2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TardbpQ921F2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TardbpQ921F2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TardbpQ921F2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TardbpQ921F2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TardbpQ921F2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TardbpQ921F2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TardbpQ921F2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TardbpQ921F2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TardbpQ921F2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TardbpQ921F2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TardbpQ921F2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TardbpQ921F2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TardbpQ921F2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TardbpQ921F2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TardbpQ921F2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TardbpQ921F2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TardbpQ921F2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TardbpQ921F2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TardbpQ921F2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TardbpQ921F2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TardbpQ921F2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TardbpQ921F2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TardbpQ921F2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TardbpQ921F2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TardbpQ921F2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TardbpQ921F2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TardbpQ921F2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TardbpQ921F2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TardbpQ921F2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TardbpQ921F2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TardbpQ921F2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TardbpQ921F2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TardbpQ921F2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TardbpQ921F2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TardbpQ921F2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TardbpQ921F2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TardbpQ921F2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TardbpQ921F2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TardbpQ921F2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TardbpQ921F2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TardbpQ921F2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TardbpQ921F2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TardbpQ921F2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TardbpQ921F2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TardbpQ921F2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TardbpQ921F2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TardbpQ921F2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TardbpQ921F2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TardbpQ921F2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TardbpQ921F2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TardbpQ921F2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TardbpQ921F2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TardbpQ921F2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TardbpQ921F2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TardbpQ921F2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TardbpQ921F2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TardbpQ921F2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TardbpQ921F2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TardbpQ921F2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TardbpQ921F2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TardbpQ921F2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TardbpQ921F2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TardbpQ921F2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TardbpQ921F2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TardbpQ921F2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TardbpQ921F2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TardbpQ921F2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TardbpQ921F2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TardbpQ921F2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TardbpQ921F2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms