Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpe65Q91ZQ5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rpe65Q91ZQ5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpe65Q91ZQ5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpe65Q91ZQ5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpe65Q91ZQ5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpe65Q91ZQ5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpe65Q91ZQ5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpe65Q91ZQ5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpe65Q91ZQ5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpe65Q91ZQ5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpe65Q91ZQ5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpe65Q91ZQ5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpe65Q91ZQ5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpe65Q91ZQ5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpe65Q91ZQ5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpe65Q91ZQ5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpe65Q91ZQ5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpe65Q91ZQ5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpe65Q91ZQ5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpe65Q91ZQ5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpe65Q91ZQ5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpe65Q91ZQ5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpe65Q91ZQ5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpe65Q91ZQ5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpe65Q91ZQ5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpe65Q91ZQ5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpe65Q91ZQ5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpe65Q91ZQ5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpe65Q91ZQ5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpe65Q91ZQ5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpe65Q91ZQ5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpe65Q91ZQ5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpe65Q91ZQ5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpe65Q91ZQ5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpe65Q91ZQ5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpe65Q91ZQ5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpe65Q91ZQ5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpe65Q91ZQ5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpe65Q91ZQ5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpe65Q91ZQ5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpe65Q91ZQ5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rpe65Q91ZQ5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rpe65Q91ZQ5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpe65Q91ZQ5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpe65Q91ZQ5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpe65Q91ZQ5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpe65Q91ZQ5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpe65Q91ZQ5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpe65Q91ZQ5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpe65Q91ZQ5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpe65Q91ZQ5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpe65Q91ZQ5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpe65Q91ZQ5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpe65Q91ZQ5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpe65Q91ZQ5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpe65Q91ZQ5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpe65Q91ZQ5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpe65Q91ZQ5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpe65Q91ZQ5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpe65Q91ZQ5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpe65Q91ZQ5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpe65Q91ZQ5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpe65Q91ZQ5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpe65Q91ZQ5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rpe65Q91ZQ5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpe65Q91ZQ5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpe65Q91ZQ5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpe65Q91ZQ5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpe65Q91ZQ5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpe65Q91ZQ5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpe65Q91ZQ5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpe65Q91ZQ5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpe65Q91ZQ5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpe65Q91ZQ5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpe65Q91ZQ5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpe65Q91ZQ5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpe65Q91ZQ5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpe65Q91ZQ5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpe65Q91ZQ5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpe65Q91ZQ5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpe65Q91ZQ5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpe65Q91ZQ5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rpe65Q91ZQ5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rpe65Q91ZQ5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpe65Q91ZQ5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpe65Q91ZQ5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpe65Q91ZQ5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpe65Q91ZQ5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpe65Q91ZQ5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpe65Q91ZQ5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpe65Q91ZQ5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpe65Q91ZQ5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpe65Q91ZQ5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpe65Q91ZQ5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpe65Q91ZQ5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpe65Q91ZQ5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpe65Q91ZQ5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpe65Q91ZQ5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Rpe65Q91ZQ5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms