Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Synpo2Q91YE8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Synpo2Q91YE8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Synpo2Q91YE8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Synpo2Q91YE8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Synpo2Q91YE8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Synpo2Q91YE8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Synpo2Q91YE8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Synpo2Q91YE8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Synpo2Q91YE8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Synpo2Q91YE8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Synpo2Q91YE8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Synpo2Q91YE8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Synpo2Q91YE8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Synpo2Q91YE8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Synpo2Q91YE8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Synpo2Q91YE8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Synpo2Q91YE8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Synpo2Q91YE8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Synpo2Q91YE8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Synpo2Q91YE8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Synpo2Q91YE8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Synpo2Q91YE8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Synpo2Q91YE8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Synpo2Q91YE8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Synpo2Q91YE8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Synpo2Q91YE8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Synpo2Q91YE8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Synpo2Q91YE8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Synpo2Q91YE8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Synpo2Q91YE8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Synpo2Q91YE8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Synpo2Q91YE8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Synpo2Q91YE8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Synpo2Q91YE8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Synpo2Q91YE8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Synpo2Q91YE8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Synpo2Q91YE8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Synpo2Q91YE8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Synpo2Q91YE8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Synpo2Q91YE8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Synpo2Q91YE8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Synpo2Q91YE8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Synpo2Q91YE8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Synpo2Q91YE8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Synpo2Q91YE8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Synpo2Q91YE8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Synpo2Q91YE8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Synpo2Q91YE8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Synpo2Q91YE8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Synpo2Q91YE8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Synpo2Q91YE8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Synpo2Q91YE8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Synpo2Q91YE8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Synpo2Q91YE8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Synpo2Q91YE8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Synpo2Q91YE8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Synpo2Q91YE8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Synpo2Q91YE8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Synpo2Q91YE8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Synpo2Q91YE8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Synpo2Q91YE8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Synpo2Q91YE8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Synpo2Q91YE8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Synpo2Q91YE8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Synpo2Q91YE8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Synpo2Q91YE8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Synpo2Q91YE8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Synpo2Q91YE8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Synpo2Q91YE8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Synpo2Q91YE8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Synpo2Q91YE8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Synpo2Q91YE8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Synpo2Q91YE8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Synpo2Q91YE8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Synpo2Q91YE8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Synpo2Q91YE8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Synpo2Q91YE8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Synpo2Q91YE8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Synpo2Q91YE8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Synpo2Q91YE8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Synpo2Q91YE8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Synpo2Q91YE8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Synpo2Q91YE8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Synpo2Q91YE8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Synpo2Q91YE8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Synpo2Q91YE8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Synpo2Q91YE8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Synpo2Q91YE8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Synpo2Q91YE8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Synpo2Q91YE8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Synpo2Q91YE8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Synpo2Q91YE8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Synpo2Q91YE8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Synpo2Q91YE8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Synpo2Q91YE8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Synpo2Q91YE8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Synpo2Q91YE8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Synpo2Q91YE8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Synpo2Q91YE8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms