Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lims2Q91XD2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Lims2Q91XD2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lims2Q91XD2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lims2Q91XD2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lims2Q91XD2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lims2Q91XD2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lims2Q91XD2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lims2Q91XD2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lims2Q91XD2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lims2Q91XD2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lims2Q91XD2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Lims2Q91XD2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lims2Q91XD2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Lims2Q91XD2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lims2Q91XD2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lims2Q91XD2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lims2Q91XD2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lims2Q91XD2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lims2Q91XD2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lims2Q91XD2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lims2Q91XD2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lims2Q91XD2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lims2Q91XD2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Lims2Q91XD2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lims2Q91XD2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lims2Q91XD2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lims2Q91XD2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lims2Q91XD2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lims2Q91XD2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lims2Q91XD2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lims2Q91XD2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lims2Q91XD2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lims2Q91XD2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lims2Q91XD2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Lims2Q91XD2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lims2Q91XD2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lims2Q91XD2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lims2Q91XD2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lims2Q91XD2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lims2Q91XD2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lims2Q91XD2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lims2Q91XD2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lims2Q91XD2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lims2Q91XD2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lims2Q91XD2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lims2Q91XD2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lims2Q91XD2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lims2Q91XD2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lims2Q91XD2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lims2Q91XD2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lims2Q91XD2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Lims2Q91XD2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lims2Q91XD2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lims2Q91XD2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lims2Q91XD2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lims2Q91XD2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lims2Q91XD2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lims2Q91XD2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lims2Q91XD2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lims2Q91XD2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lims2Q91XD2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lims2Q91XD2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lims2Q91XD2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lims2Q91XD2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lims2Q91XD2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Lims2Q91XD2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lims2Q91XD2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lims2Q91XD2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lims2Q91XD2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lims2Q91XD2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lims2Q91XD2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lims2Q91XD2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lims2Q91XD2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lims2Q91XD2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lims2Q91XD2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lims2Q91XD2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lims2Q91XD2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lims2Q91XD2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Lims2Q91XD2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lims2Q91XD2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lims2Q91XD2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lims2Q91XD2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lims2Q91XD2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lims2Q91XD2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Lims2Q91XD2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lims2Q91XD2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lims2Q91XD2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lims2Q91XD2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lims2Q91XD2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lims2Q91XD2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lims2Q91XD2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lims2Q91XD2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lims2Q91XD2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lims2Q91XD2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lims2Q91XD2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lims2Q91XD2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lims2Q91XD2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lims2Q91XD2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lims2Q91XD2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182.6 ms