Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhdc3Q8VEM9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhdc3Q8VEM9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhdc3Q8VEM9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhdc3Q8VEM9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhdc3Q8VEM9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhdc3Q8VEM9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhdc3Q8VEM9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhdc3Q8VEM9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhdc3Q8VEM9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhdc3Q8VEM9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhdc3Q8VEM9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhdc3Q8VEM9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhdc3Q8VEM9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhdc3Q8VEM9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhdc3Q8VEM9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhdc3Q8VEM9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhdc3Q8VEM9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhdc3Q8VEM9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Klhdc3Q8VEM9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhdc3Q8VEM9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhdc3Q8VEM9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhdc3Q8VEM9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhdc3Q8VEM9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhdc3Q8VEM9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhdc3Q8VEM9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhdc3Q8VEM9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhdc3Q8VEM9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhdc3Q8VEM9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhdc3Q8VEM9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhdc3Q8VEM9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhdc3Q8VEM9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhdc3Q8VEM9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhdc3Q8VEM9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhdc3Q8VEM9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhdc3Q8VEM9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhdc3Q8VEM9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhdc3Q8VEM9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhdc3Q8VEM9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhdc3Q8VEM9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhdc3Q8VEM9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Klhdc3Q8VEM9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Klhdc3Q8VEM9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Klhdc3Q8VEM9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Klhdc3Q8VEM9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Klhdc3Q8VEM9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Klhdc3Q8VEM9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.3■■□□□ 1
Klhdc3Q8VEM9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Klhdc3Q8VEM9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhdc3Q8VEM9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Klhdc3Q8VEM9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhdc3Q8VEM9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhdc3Q8VEM9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhdc3Q8VEM9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhdc3Q8VEM9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhdc3Q8VEM9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc3Q8VEM9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc3Q8VEM9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc3Q8VEM9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc3Q8VEM9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhdc3Q8VEM9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhdc3Q8VEM9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhdc3Q8VEM9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhdc3Q8VEM9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhdc3Q8VEM9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhdc3Q8VEM9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhdc3Q8VEM9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhdc3Q8VEM9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhdc3Q8VEM9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhdc3Q8VEM9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhdc3Q8VEM9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhdc3Q8VEM9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhdc3Q8VEM9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhdc3Q8VEM9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhdc3Q8VEM9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhdc3Q8VEM9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhdc3Q8VEM9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhdc3Q8VEM9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhdc3Q8VEM9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhdc3Q8VEM9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhdc3Q8VEM9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhdc3Q8VEM9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhdc3Q8VEM9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhdc3Q8VEM9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhdc3Q8VEM9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhdc3Q8VEM9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhdc3Q8VEM9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhdc3Q8VEM9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhdc3Q8VEM9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhdc3Q8VEM9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhdc3Q8VEM9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhdc3Q8VEM9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhdc3Q8VEM9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhdc3Q8VEM9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Klhdc3Q8VEM9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Klhdc3Q8VEM9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhdc3Q8VEM9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhdc3Q8VEM9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhdc3Q8VEM9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhdc3Q8VEM9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms