Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1Q0

Stx19, Syntaxin-19, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx19Q8R1Q0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stx19Q8R1Q0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stx19Q8R1Q0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stx19Q8R1Q0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stx19Q8R1Q0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stx19Q8R1Q0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stx19Q8R1Q0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Stx19Q8R1Q0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stx19Q8R1Q0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Stx19Q8R1Q0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stx19Q8R1Q0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stx19Q8R1Q0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stx19Q8R1Q0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stx19Q8R1Q0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stx19Q8R1Q0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stx19Q8R1Q0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stx19Q8R1Q0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stx19Q8R1Q0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stx19Q8R1Q0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stx19Q8R1Q0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stx19Q8R1Q0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stx19Q8R1Q0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Stx19Q8R1Q0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stx19Q8R1Q0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stx19Q8R1Q0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stx19Q8R1Q0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stx19Q8R1Q0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stx19Q8R1Q0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stx19Q8R1Q0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stx19Q8R1Q0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stx19Q8R1Q0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stx19Q8R1Q0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stx19Q8R1Q0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stx19Q8R1Q0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stx19Q8R1Q0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stx19Q8R1Q0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stx19Q8R1Q0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stx19Q8R1Q0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stx19Q8R1Q0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Stx19Q8R1Q0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stx19Q8R1Q0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stx19Q8R1Q0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stx19Q8R1Q0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stx19Q8R1Q0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stx19Q8R1Q0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stx19Q8R1Q0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Stx19Q8R1Q0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stx19Q8R1Q0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stx19Q8R1Q0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stx19Q8R1Q0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stx19Q8R1Q0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stx19Q8R1Q0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Stx19Q8R1Q0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stx19Q8R1Q0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stx19Q8R1Q0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stx19Q8R1Q0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stx19Q8R1Q0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stx19Q8R1Q0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stx19Q8R1Q0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stx19Q8R1Q0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stx19Q8R1Q0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stx19Q8R1Q0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stx19Q8R1Q0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stx19Q8R1Q0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stx19Q8R1Q0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Stx19Q8R1Q0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Stx19Q8R1Q0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stx19Q8R1Q0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stx19Q8R1Q0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx19Q8R1Q0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stx19Q8R1Q0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stx19Q8R1Q0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stx19Q8R1Q0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stx19Q8R1Q0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stx19Q8R1Q0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stx19Q8R1Q0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stx19Q8R1Q0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Stx19Q8R1Q0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stx19Q8R1Q0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stx19Q8R1Q0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stx19Q8R1Q0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stx19Q8R1Q0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stx19Q8R1Q0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stx19Q8R1Q0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stx19Q8R1Q0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stx19Q8R1Q0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Stx19Q8R1Q0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stx19Q8R1Q0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stx19Q8R1Q0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stx19Q8R1Q0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stx19Q8R1Q0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stx19Q8R1Q0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stx19Q8R1Q0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stx19Q8R1Q0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stx19Q8R1Q0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx19Q8R1Q0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx19Q8R1Q0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx19Q8R1Q0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx19Q8R1Q0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stx19Q8R1Q0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms