Protein–RNA interactions for Protein: Q8R149

Bud13, BUD13 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud13Q8R149 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Bud13Q8R149 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Bud13Q8R149 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Bud13Q8R149 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Bud13Q8R149 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Bud13Q8R149 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Bud13Q8R149 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Bud13Q8R149 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Bud13Q8R149 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Bud13Q8R149 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Bud13Q8R149 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Bud13Q8R149 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Bud13Q8R149 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Bud13Q8R149 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Bud13Q8R149 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Bud13Q8R149 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Bud13Q8R149 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Bud13Q8R149 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Bud13Q8R149 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Bud13Q8R149 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Bud13Q8R149 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Bud13Q8R149 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Bud13Q8R149 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Bud13Q8R149 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Bud13Q8R149 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Bud13Q8R149 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Bud13Q8R149 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Bud13Q8R149 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Bud13Q8R149 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Bud13Q8R149 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Bud13Q8R149 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Bud13Q8R149 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Bud13Q8R149 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Bud13Q8R149 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Bud13Q8R149 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Bud13Q8R149 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Bud13Q8R149 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Bud13Q8R149 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Bud13Q8R149 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Bud13Q8R149 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Bud13Q8R149 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Bud13Q8R149 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Bud13Q8R149 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Bud13Q8R149 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Bud13Q8R149 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Bud13Q8R149 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Bud13Q8R149 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Bud13Q8R149 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Bud13Q8R149 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Bud13Q8R149 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Bud13Q8R149 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Bud13Q8R149 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Bud13Q8R149 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Bud13Q8R149 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Bud13Q8R149 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Bud13Q8R149 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Bud13Q8R149 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Bud13Q8R149 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Bud13Q8R149 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Bud13Q8R149 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Bud13Q8R149 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Bud13Q8R149 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Bud13Q8R149 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Bud13Q8R149 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Bud13Q8R149 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Bud13Q8R149 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Bud13Q8R149 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Bud13Q8R149 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Bud13Q8R149 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Bud13Q8R149 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Bud13Q8R149 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Bud13Q8R149 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Bud13Q8R149 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Bud13Q8R149 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Bud13Q8R149 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Bud13Q8R149 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Bud13Q8R149 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Bud13Q8R149 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Bud13Q8R149 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Bud13Q8R149 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Bud13Q8R149 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Bud13Q8R149 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Bud13Q8R149 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Bud13Q8R149 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Bud13Q8R149 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Bud13Q8R149 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Bud13Q8R149 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Bud13Q8R149 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Bud13Q8R149 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Bud13Q8R149 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Bud13Q8R149 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Bud13Q8R149 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Bud13Q8R149 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Bud13Q8R149 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Bud13Q8R149 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Bud13Q8R149 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Bud13Q8R149 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Bud13Q8R149 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Bud13Q8R149 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Bud13Q8R149 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms