Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Colec12Q8K4Q8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Colec12Q8K4Q8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Colec12Q8K4Q8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Colec12Q8K4Q8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Colec12Q8K4Q8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Colec12Q8K4Q8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Colec12Q8K4Q8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Colec12Q8K4Q8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Colec12Q8K4Q8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Colec12Q8K4Q8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Colec12Q8K4Q8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Colec12Q8K4Q8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Colec12Q8K4Q8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Colec12Q8K4Q8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Colec12Q8K4Q8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Colec12Q8K4Q8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Colec12Q8K4Q8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Colec12Q8K4Q8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Colec12Q8K4Q8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Colec12Q8K4Q8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Colec12Q8K4Q8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Colec12Q8K4Q8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Colec12Q8K4Q8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Colec12Q8K4Q8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Colec12Q8K4Q8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Colec12Q8K4Q8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Colec12Q8K4Q8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Colec12Q8K4Q8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Colec12Q8K4Q8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Colec12Q8K4Q8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Colec12Q8K4Q8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Colec12Q8K4Q8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Colec12Q8K4Q8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Colec12Q8K4Q8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Colec12Q8K4Q8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Colec12Q8K4Q8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Colec12Q8K4Q8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Colec12Q8K4Q8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Colec12Q8K4Q8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Colec12Q8K4Q8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Colec12Q8K4Q8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Colec12Q8K4Q8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Colec12Q8K4Q8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Colec12Q8K4Q8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Colec12Q8K4Q8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Colec12Q8K4Q8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Colec12Q8K4Q8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Colec12Q8K4Q8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Colec12Q8K4Q8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Colec12Q8K4Q8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Colec12Q8K4Q8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Colec12Q8K4Q8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Colec12Q8K4Q8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Colec12Q8K4Q8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Colec12Q8K4Q8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Colec12Q8K4Q8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Colec12Q8K4Q8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Colec12Q8K4Q8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Colec12Q8K4Q8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Colec12Q8K4Q8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Colec12Q8K4Q8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Colec12Q8K4Q8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Colec12Q8K4Q8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Colec12Q8K4Q8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Colec12Q8K4Q8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Colec12Q8K4Q8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Colec12Q8K4Q8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Colec12Q8K4Q8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Colec12Q8K4Q8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Colec12Q8K4Q8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Colec12Q8K4Q8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Colec12Q8K4Q8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Colec12Q8K4Q8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Colec12Q8K4Q8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Colec12Q8K4Q8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Colec12Q8K4Q8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Colec12Q8K4Q8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Colec12Q8K4Q8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Colec12Q8K4Q8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Colec12Q8K4Q8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Colec12Q8K4Q8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Colec12Q8K4Q8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Colec12Q8K4Q8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Colec12Q8K4Q8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Colec12Q8K4Q8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Colec12Q8K4Q8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Colec12Q8K4Q8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Colec12Q8K4Q8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Colec12Q8K4Q8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Colec12Q8K4Q8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Colec12Q8K4Q8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Colec12Q8K4Q8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Colec12Q8K4Q8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Colec12Q8K4Q8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Colec12Q8K4Q8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Colec12Q8K4Q8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Colec12Q8K4Q8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Colec12Q8K4Q8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Colec12Q8K4Q8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms