Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Colec12Q8K4Q8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Colec12Q8K4Q8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Colec12Q8K4Q8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Colec12Q8K4Q8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Colec12Q8K4Q8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Colec12Q8K4Q8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Colec12Q8K4Q8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Colec12Q8K4Q8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Colec12Q8K4Q8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Colec12Q8K4Q8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Colec12Q8K4Q8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Colec12Q8K4Q8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Colec12Q8K4Q8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Colec12Q8K4Q8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Colec12Q8K4Q8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Colec12Q8K4Q8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Colec12Q8K4Q8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Colec12Q8K4Q8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Colec12Q8K4Q8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Colec12Q8K4Q8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Colec12Q8K4Q8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Colec12Q8K4Q8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Colec12Q8K4Q8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Colec12Q8K4Q8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Colec12Q8K4Q8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Colec12Q8K4Q8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Colec12Q8K4Q8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Colec12Q8K4Q8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Colec12Q8K4Q8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Colec12Q8K4Q8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Colec12Q8K4Q8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Colec12Q8K4Q8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Colec12Q8K4Q8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Colec12Q8K4Q8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Colec12Q8K4Q8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Colec12Q8K4Q8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Colec12Q8K4Q8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Colec12Q8K4Q8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Colec12Q8K4Q8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Colec12Q8K4Q8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Colec12Q8K4Q8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Colec12Q8K4Q8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Colec12Q8K4Q8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Colec12Q8K4Q8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Colec12Q8K4Q8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Colec12Q8K4Q8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Colec12Q8K4Q8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Colec12Q8K4Q8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Colec12Q8K4Q8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Colec12Q8K4Q8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Colec12Q8K4Q8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Colec12Q8K4Q8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Colec12Q8K4Q8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Colec12Q8K4Q8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Colec12Q8K4Q8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Colec12Q8K4Q8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Colec12Q8K4Q8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Colec12Q8K4Q8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Colec12Q8K4Q8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Colec12Q8K4Q8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Colec12Q8K4Q8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Colec12Q8K4Q8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Colec12Q8K4Q8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Colec12Q8K4Q8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Colec12Q8K4Q8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Colec12Q8K4Q8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Colec12Q8K4Q8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Colec12Q8K4Q8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Colec12Q8K4Q8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Colec12Q8K4Q8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Colec12Q8K4Q8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Colec12Q8K4Q8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Colec12Q8K4Q8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Colec12Q8K4Q8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Colec12Q8K4Q8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Colec12Q8K4Q8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Colec12Q8K4Q8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Colec12Q8K4Q8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Colec12Q8K4Q8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Colec12Q8K4Q8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Colec12Q8K4Q8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Colec12Q8K4Q8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Colec12Q8K4Q8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Colec12Q8K4Q8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Colec12Q8K4Q8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Colec12Q8K4Q8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Colec12Q8K4Q8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Colec12Q8K4Q8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Colec12Q8K4Q8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Colec12Q8K4Q8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Colec12Q8K4Q8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Colec12Q8K4Q8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Colec12Q8K4Q8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Colec12Q8K4Q8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Colec12Q8K4Q8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Colec12Q8K4Q8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Colec12Q8K4Q8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Colec12Q8K4Q8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Colec12Q8K4Q8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms