Protein–RNA interactions for Protein: Q8K411

Pitrm1, Presequence protease, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitrm1Q8K411 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pitrm1Q8K411 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Pitrm1Q8K411 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pitrm1Q8K411 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pitrm1Q8K411 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pitrm1Q8K411 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pitrm1Q8K411 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Pitrm1Q8K411 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pitrm1Q8K411 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pitrm1Q8K411 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pitrm1Q8K411 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pitrm1Q8K411 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pitrm1Q8K411 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pitrm1Q8K411 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pitrm1Q8K411 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pitrm1Q8K411 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pitrm1Q8K411 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pitrm1Q8K411 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pitrm1Q8K411 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pitrm1Q8K411 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pitrm1Q8K411 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pitrm1Q8K411 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pitrm1Q8K411 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pitrm1Q8K411 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pitrm1Q8K411 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pitrm1Q8K411 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pitrm1Q8K411 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pitrm1Q8K411 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pitrm1Q8K411 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Pitrm1Q8K411 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pitrm1Q8K411 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pitrm1Q8K411 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pitrm1Q8K411 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pitrm1Q8K411 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Pitrm1Q8K411 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pitrm1Q8K411 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pitrm1Q8K411 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pitrm1Q8K411 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pitrm1Q8K411 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pitrm1Q8K411 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pitrm1Q8K411 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pitrm1Q8K411 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pitrm1Q8K411 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pitrm1Q8K411 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pitrm1Q8K411 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pitrm1Q8K411 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pitrm1Q8K411 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Pitrm1Q8K411 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pitrm1Q8K411 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pitrm1Q8K411 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pitrm1Q8K411 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pitrm1Q8K411 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pitrm1Q8K411 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Pitrm1Q8K411 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pitrm1Q8K411 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Pitrm1Q8K411 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pitrm1Q8K411 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pitrm1Q8K411 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pitrm1Q8K411 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pitrm1Q8K411 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pitrm1Q8K411 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pitrm1Q8K411 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pitrm1Q8K411 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pitrm1Q8K411 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pitrm1Q8K411 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pitrm1Q8K411 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pitrm1Q8K411 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pitrm1Q8K411 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Pitrm1Q8K411 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pitrm1Q8K411 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pitrm1Q8K411 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pitrm1Q8K411 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pitrm1Q8K411 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pitrm1Q8K411 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pitrm1Q8K411 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pitrm1Q8K411 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pitrm1Q8K411 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pitrm1Q8K411 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pitrm1Q8K411 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Pitrm1Q8K411 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Pitrm1Q8K411 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pitrm1Q8K411 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pitrm1Q8K411 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pitrm1Q8K411 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pitrm1Q8K411 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pitrm1Q8K411 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pitrm1Q8K411 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pitrm1Q8K411 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pitrm1Q8K411 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pitrm1Q8K411 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pitrm1Q8K411 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pitrm1Q8K411 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pitrm1Q8K411 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pitrm1Q8K411 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pitrm1Q8K411 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pitrm1Q8K411 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Pitrm1Q8K411 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pitrm1Q8K411 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pitrm1Q8K411 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pitrm1Q8K411 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms