Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ4

Gpc3, Glypican-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc3Q8CFZ4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gpc3Q8CFZ4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gpc3Q8CFZ4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gpc3Q8CFZ4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gpc3Q8CFZ4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gpc3Q8CFZ4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gpc3Q8CFZ4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gpc3Q8CFZ4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gpc3Q8CFZ4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gpc3Q8CFZ4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Gpc3Q8CFZ4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gpc3Q8CFZ4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gpc3Q8CFZ4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gpc3Q8CFZ4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gpc3Q8CFZ4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gpc3Q8CFZ4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gpc3Q8CFZ4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gpc3Q8CFZ4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gpc3Q8CFZ4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gpc3Q8CFZ4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Gpc3Q8CFZ4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Gpc3Q8CFZ4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gpc3Q8CFZ4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gpc3Q8CFZ4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gpc3Q8CFZ4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gpc3Q8CFZ4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gpc3Q8CFZ4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gpc3Q8CFZ4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gpc3Q8CFZ4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gpc3Q8CFZ4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Gpc3Q8CFZ4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gpc3Q8CFZ4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gpc3Q8CFZ4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gpc3Q8CFZ4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gpc3Q8CFZ4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gpc3Q8CFZ4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gpc3Q8CFZ4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gpc3Q8CFZ4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gpc3Q8CFZ4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gpc3Q8CFZ4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gpc3Q8CFZ4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Gpc3Q8CFZ4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gpc3Q8CFZ4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gpc3Q8CFZ4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gpc3Q8CFZ4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gpc3Q8CFZ4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gpc3Q8CFZ4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gpc3Q8CFZ4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gpc3Q8CFZ4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gpc3Q8CFZ4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gpc3Q8CFZ4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gpc3Q8CFZ4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gpc3Q8CFZ4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gpc3Q8CFZ4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gpc3Q8CFZ4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gpc3Q8CFZ4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gpc3Q8CFZ4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gpc3Q8CFZ4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gpc3Q8CFZ4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Gpc3Q8CFZ4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gpc3Q8CFZ4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gpc3Q8CFZ4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gpc3Q8CFZ4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Gpc3Q8CFZ4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Gpc3Q8CFZ4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gpc3Q8CFZ4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gpc3Q8CFZ4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gpc3Q8CFZ4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Gpc3Q8CFZ4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gpc3Q8CFZ4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gpc3Q8CFZ4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gpc3Q8CFZ4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Gpc3Q8CFZ4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gpc3Q8CFZ4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Gpc3Q8CFZ4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gpc3Q8CFZ4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gpc3Q8CFZ4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gpc3Q8CFZ4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gpc3Q8CFZ4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gpc3Q8CFZ4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gpc3Q8CFZ4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gpc3Q8CFZ4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gpc3Q8CFZ4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gpc3Q8CFZ4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gpc3Q8CFZ4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gpc3Q8CFZ4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gpc3Q8CFZ4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gpc3Q8CFZ4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gpc3Q8CFZ4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gpc3Q8CFZ4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gpc3Q8CFZ4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gpc3Q8CFZ4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gpc3Q8CFZ4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gpc3Q8CFZ4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gpc3Q8CFZ4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Gpc3Q8CFZ4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gpc3Q8CFZ4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gpc3Q8CFZ4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gpc3Q8CFZ4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gpc3Q8CFZ4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms