Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB19

Phtf2, Putative homeodomain transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf2Q8CB19 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Phtf2Q8CB19 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Phtf2Q8CB19 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Phtf2Q8CB19 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Phtf2Q8CB19 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Phtf2Q8CB19 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Phtf2Q8CB19 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Phtf2Q8CB19 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Phtf2Q8CB19 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Phtf2Q8CB19 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Phtf2Q8CB19 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Phtf2Q8CB19 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Phtf2Q8CB19 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Phtf2Q8CB19 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Phtf2Q8CB19 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Phtf2Q8CB19 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Phtf2Q8CB19 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Phtf2Q8CB19 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Phtf2Q8CB19 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Phtf2Q8CB19 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Phtf2Q8CB19 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Phtf2Q8CB19 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Phtf2Q8CB19 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Phtf2Q8CB19 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Phtf2Q8CB19 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Phtf2Q8CB19 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Phtf2Q8CB19 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Phtf2Q8CB19 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Phtf2Q8CB19 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Phtf2Q8CB19 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Phtf2Q8CB19 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Phtf2Q8CB19 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Phtf2Q8CB19 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Phtf2Q8CB19 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Phtf2Q8CB19 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Phtf2Q8CB19 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Phtf2Q8CB19 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Phtf2Q8CB19 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Phtf2Q8CB19 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Phtf2Q8CB19 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Phtf2Q8CB19 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Phtf2Q8CB19 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Phtf2Q8CB19 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Phtf2Q8CB19 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Phtf2Q8CB19 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Phtf2Q8CB19 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Phtf2Q8CB19 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Phtf2Q8CB19 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Phtf2Q8CB19 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Phtf2Q8CB19 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Phtf2Q8CB19 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Phtf2Q8CB19 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Phtf2Q8CB19 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Phtf2Q8CB19 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Phtf2Q8CB19 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Phtf2Q8CB19 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Phtf2Q8CB19 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Phtf2Q8CB19 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Phtf2Q8CB19 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Phtf2Q8CB19 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Phtf2Q8CB19 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Phtf2Q8CB19 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Phtf2Q8CB19 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Phtf2Q8CB19 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Phtf2Q8CB19 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Phtf2Q8CB19 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Phtf2Q8CB19 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Phtf2Q8CB19 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Phtf2Q8CB19 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Phtf2Q8CB19 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Phtf2Q8CB19 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Phtf2Q8CB19 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Phtf2Q8CB19 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Phtf2Q8CB19 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Phtf2Q8CB19 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Phtf2Q8CB19 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Phtf2Q8CB19 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Phtf2Q8CB19 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Phtf2Q8CB19 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Phtf2Q8CB19 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Phtf2Q8CB19 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Phtf2Q8CB19 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Phtf2Q8CB19 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Phtf2Q8CB19 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Phtf2Q8CB19 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Phtf2Q8CB19 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Phtf2Q8CB19 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Phtf2Q8CB19 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Phtf2Q8CB19 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Phtf2Q8CB19 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Phtf2Q8CB19 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Phtf2Q8CB19 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Phtf2Q8CB19 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Phtf2Q8CB19 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Phtf2Q8CB19 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Phtf2Q8CB19 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Phtf2Q8CB19 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Phtf2Q8CB19 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Phtf2Q8CB19 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Phtf2Q8CB19 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms