Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx16Q8C080 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snx16Q8C080 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snx16Q8C080 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx16Q8C080 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx16Q8C080 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx16Q8C080 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx16Q8C080 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx16Q8C080 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx16Q8C080 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx16Q8C080 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx16Q8C080 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx16Q8C080 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx16Q8C080 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx16Q8C080 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx16Q8C080 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx16Q8C080 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx16Q8C080 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx16Q8C080 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snx16Q8C080 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snx16Q8C080 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx16Q8C080 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx16Q8C080 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx16Q8C080 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snx16Q8C080 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx16Q8C080 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx16Q8C080 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx16Q8C080 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Snx16Q8C080 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx16Q8C080 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx16Q8C080 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx16Q8C080 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx16Q8C080 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx16Q8C080 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx16Q8C080 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx16Q8C080 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx16Q8C080 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx16Q8C080 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx16Q8C080 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx16Q8C080 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx16Q8C080 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx16Q8C080 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx16Q8C080 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx16Q8C080 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx16Q8C080 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Snx16Q8C080 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snx16Q8C080 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snx16Q8C080 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx16Q8C080 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx16Q8C080 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx16Q8C080 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx16Q8C080 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx16Q8C080 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx16Q8C080 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx16Q8C080 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx16Q8C080 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx16Q8C080 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx16Q8C080 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx16Q8C080 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx16Q8C080 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx16Q8C080 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx16Q8C080 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx16Q8C080 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx16Q8C080 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx16Q8C080 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx16Q8C080 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx16Q8C080 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx16Q8C080 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx16Q8C080 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx16Q8C080 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx16Q8C080 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx16Q8C080 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx16Q8C080 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx16Q8C080 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx16Q8C080 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx16Q8C080 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx16Q8C080 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx16Q8C080 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx16Q8C080 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx16Q8C080 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snx16Q8C080 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snx16Q8C080 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx16Q8C080 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx16Q8C080 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx16Q8C080 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx16Q8C080 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx16Q8C080 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx16Q8C080 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx16Q8C080 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx16Q8C080 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx16Q8C080 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx16Q8C080 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx16Q8C080 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx16Q8C080 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx16Q8C080 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx16Q8C080 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx16Q8C080 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx16Q8C080 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx16Q8C080 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx16Q8C080 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms