Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY02

Nkrf, NF-kappa-B-repressing factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkrfQ8BY02 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NkrfQ8BY02 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NkrfQ8BY02 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NkrfQ8BY02 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NkrfQ8BY02 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NkrfQ8BY02 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NkrfQ8BY02 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NkrfQ8BY02 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NkrfQ8BY02 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NkrfQ8BY02 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NkrfQ8BY02 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NkrfQ8BY02 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NkrfQ8BY02 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NkrfQ8BY02 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NkrfQ8BY02 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NkrfQ8BY02 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NkrfQ8BY02 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NkrfQ8BY02 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NkrfQ8BY02 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NkrfQ8BY02 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NkrfQ8BY02 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
NkrfQ8BY02 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NkrfQ8BY02 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NkrfQ8BY02 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NkrfQ8BY02 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NkrfQ8BY02 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NkrfQ8BY02 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NkrfQ8BY02 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NkrfQ8BY02 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NkrfQ8BY02 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NkrfQ8BY02 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NkrfQ8BY02 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NkrfQ8BY02 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NkrfQ8BY02 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NkrfQ8BY02 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NkrfQ8BY02 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NkrfQ8BY02 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NkrfQ8BY02 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NkrfQ8BY02 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NkrfQ8BY02 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NkrfQ8BY02 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NkrfQ8BY02 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NkrfQ8BY02 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NkrfQ8BY02 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NkrfQ8BY02 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NkrfQ8BY02 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NkrfQ8BY02 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NkrfQ8BY02 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NkrfQ8BY02 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NkrfQ8BY02 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NkrfQ8BY02 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NkrfQ8BY02 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NkrfQ8BY02 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NkrfQ8BY02 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NkrfQ8BY02 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NkrfQ8BY02 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NkrfQ8BY02 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NkrfQ8BY02 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NkrfQ8BY02 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NkrfQ8BY02 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NkrfQ8BY02 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NkrfQ8BY02 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NkrfQ8BY02 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NkrfQ8BY02 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NkrfQ8BY02 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NkrfQ8BY02 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NkrfQ8BY02 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NkrfQ8BY02 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NkrfQ8BY02 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NkrfQ8BY02 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NkrfQ8BY02 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NkrfQ8BY02 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NkrfQ8BY02 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NkrfQ8BY02 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NkrfQ8BY02 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NkrfQ8BY02 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NkrfQ8BY02 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NkrfQ8BY02 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NkrfQ8BY02 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NkrfQ8BY02 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NkrfQ8BY02 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NkrfQ8BY02 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NkrfQ8BY02 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NkrfQ8BY02 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NkrfQ8BY02 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NkrfQ8BY02 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NkrfQ8BY02 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NkrfQ8BY02 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NkrfQ8BY02 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NkrfQ8BY02 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NkrfQ8BY02 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NkrfQ8BY02 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NkrfQ8BY02 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NkrfQ8BY02 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NkrfQ8BY02 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NkrfQ8BY02 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NkrfQ8BY02 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NkrfQ8BY02 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NkrfQ8BY02 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NkrfQ8BY02 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms