Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trerf1Q8BXJ2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trerf1Q8BXJ2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trerf1Q8BXJ2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Trerf1Q8BXJ2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trerf1Q8BXJ2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trerf1Q8BXJ2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trerf1Q8BXJ2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trerf1Q8BXJ2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trerf1Q8BXJ2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trerf1Q8BXJ2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Trerf1Q8BXJ2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Trerf1Q8BXJ2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trerf1Q8BXJ2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trerf1Q8BXJ2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trerf1Q8BXJ2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trerf1Q8BXJ2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trerf1Q8BXJ2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Trerf1Q8BXJ2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trerf1Q8BXJ2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trerf1Q8BXJ2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trerf1Q8BXJ2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Trerf1Q8BXJ2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trerf1Q8BXJ2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trerf1Q8BXJ2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trerf1Q8BXJ2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trerf1Q8BXJ2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trerf1Q8BXJ2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trerf1Q8BXJ2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trerf1Q8BXJ2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trerf1Q8BXJ2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trerf1Q8BXJ2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trerf1Q8BXJ2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trerf1Q8BXJ2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trerf1Q8BXJ2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trerf1Q8BXJ2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trerf1Q8BXJ2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trerf1Q8BXJ2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trerf1Q8BXJ2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trerf1Q8BXJ2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trerf1Q8BXJ2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trerf1Q8BXJ2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trerf1Q8BXJ2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trerf1Q8BXJ2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trerf1Q8BXJ2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trerf1Q8BXJ2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trerf1Q8BXJ2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trerf1Q8BXJ2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trerf1Q8BXJ2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trerf1Q8BXJ2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trerf1Q8BXJ2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trerf1Q8BXJ2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trerf1Q8BXJ2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trerf1Q8BXJ2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trerf1Q8BXJ2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trerf1Q8BXJ2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trerf1Q8BXJ2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trerf1Q8BXJ2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trerf1Q8BXJ2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trerf1Q8BXJ2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trerf1Q8BXJ2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trerf1Q8BXJ2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trerf1Q8BXJ2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trerf1Q8BXJ2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Trerf1Q8BXJ2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trerf1Q8BXJ2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trerf1Q8BXJ2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trerf1Q8BXJ2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Trerf1Q8BXJ2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trerf1Q8BXJ2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trerf1Q8BXJ2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trerf1Q8BXJ2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trerf1Q8BXJ2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trerf1Q8BXJ2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trerf1Q8BXJ2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trerf1Q8BXJ2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trerf1Q8BXJ2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trerf1Q8BXJ2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trerf1Q8BXJ2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trerf1Q8BXJ2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trerf1Q8BXJ2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trerf1Q8BXJ2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trerf1Q8BXJ2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Trerf1Q8BXJ2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trerf1Q8BXJ2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trerf1Q8BXJ2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trerf1Q8BXJ2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trerf1Q8BXJ2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trerf1Q8BXJ2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trerf1Q8BXJ2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trerf1Q8BXJ2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trerf1Q8BXJ2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trerf1Q8BXJ2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trerf1Q8BXJ2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trerf1Q8BXJ2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trerf1Q8BXJ2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trerf1Q8BXJ2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trerf1Q8BXJ2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trerf1Q8BXJ2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trerf1Q8BXJ2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
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