Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUN5

Smad3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad3Q8BUN5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Smad3Q8BUN5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smad3Q8BUN5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Smad3Q8BUN5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Smad3Q8BUN5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Smad3Q8BUN5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Smad3Q8BUN5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Smad3Q8BUN5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smad3Q8BUN5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Smad3Q8BUN5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Smad3Q8BUN5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Smad3Q8BUN5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smad3Q8BUN5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smad3Q8BUN5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smad3Q8BUN5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smad3Q8BUN5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smad3Q8BUN5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smad3Q8BUN5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Smad3Q8BUN5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Smad3Q8BUN5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smad3Q8BUN5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smad3Q8BUN5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smad3Q8BUN5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smad3Q8BUN5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smad3Q8BUN5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smad3Q8BUN5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smad3Q8BUN5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smad3Q8BUN5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smad3Q8BUN5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smad3Q8BUN5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smad3Q8BUN5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smad3Q8BUN5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smad3Q8BUN5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smad3Q8BUN5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smad3Q8BUN5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smad3Q8BUN5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smad3Q8BUN5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smad3Q8BUN5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smad3Q8BUN5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smad3Q8BUN5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smad3Q8BUN5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smad3Q8BUN5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smad3Q8BUN5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smad3Q8BUN5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smad3Q8BUN5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smad3Q8BUN5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smad3Q8BUN5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smad3Q8BUN5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smad3Q8BUN5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smad3Q8BUN5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smad3Q8BUN5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smad3Q8BUN5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Smad3Q8BUN5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Smad3Q8BUN5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Smad3Q8BUN5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smad3Q8BUN5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smad3Q8BUN5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smad3Q8BUN5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smad3Q8BUN5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smad3Q8BUN5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smad3Q8BUN5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smad3Q8BUN5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smad3Q8BUN5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smad3Q8BUN5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smad3Q8BUN5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smad3Q8BUN5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smad3Q8BUN5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smad3Q8BUN5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Smad3Q8BUN5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Smad3Q8BUN5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smad3Q8BUN5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smad3Q8BUN5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smad3Q8BUN5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smad3Q8BUN5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smad3Q8BUN5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smad3Q8BUN5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smad3Q8BUN5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smad3Q8BUN5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smad3Q8BUN5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smad3Q8BUN5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smad3Q8BUN5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smad3Q8BUN5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smad3Q8BUN5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smad3Q8BUN5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smad3Q8BUN5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smad3Q8BUN5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smad3Q8BUN5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smad3Q8BUN5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smad3Q8BUN5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smad3Q8BUN5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smad3Q8BUN5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smad3Q8BUN5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smad3Q8BUN5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smad3Q8BUN5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smad3Q8BUN5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Smad3Q8BUN5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smad3Q8BUN5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Smad3Q8BUN5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smad3Q8BUN5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smad3Q8BUN5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms