Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Neil2Q6R2P8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Neil2Q6R2P8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Neil2Q6R2P8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Neil2Q6R2P8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Neil2Q6R2P8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Neil2Q6R2P8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Neil2Q6R2P8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Neil2Q6R2P8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Neil2Q6R2P8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Neil2Q6R2P8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Neil2Q6R2P8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Neil2Q6R2P8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Neil2Q6R2P8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Neil2Q6R2P8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Neil2Q6R2P8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Neil2Q6R2P8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Neil2Q6R2P8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Neil2Q6R2P8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Neil2Q6R2P8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Neil2Q6R2P8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neil2Q6R2P8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neil2Q6R2P8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neil2Q6R2P8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Neil2Q6R2P8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neil2Q6R2P8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neil2Q6R2P8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neil2Q6R2P8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Neil2Q6R2P8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Neil2Q6R2P8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Neil2Q6R2P8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Neil2Q6R2P8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Neil2Q6R2P8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Neil2Q6R2P8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Neil2Q6R2P8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Neil2Q6R2P8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Neil2Q6R2P8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Neil2Q6R2P8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Neil2Q6R2P8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Neil2Q6R2P8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Neil2Q6R2P8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Neil2Q6R2P8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Neil2Q6R2P8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Neil2Q6R2P8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Neil2Q6R2P8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Neil2Q6R2P8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neil2Q6R2P8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neil2Q6R2P8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neil2Q6R2P8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Neil2Q6R2P8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Neil2Q6R2P8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Neil2Q6R2P8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Neil2Q6R2P8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Neil2Q6R2P8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neil2Q6R2P8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Neil2Q6R2P8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Neil2Q6R2P8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Neil2Q6R2P8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Neil2Q6R2P8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Neil2Q6R2P8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Neil2Q6R2P8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Neil2Q6R2P8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Neil2Q6R2P8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Neil2Q6R2P8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Neil2Q6R2P8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Neil2Q6R2P8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Neil2Q6R2P8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Neil2Q6R2P8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Neil2Q6R2P8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neil2Q6R2P8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neil2Q6R2P8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neil2Q6R2P8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Neil2Q6R2P8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Neil2Q6R2P8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Neil2Q6R2P8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Neil2Q6R2P8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Neil2Q6R2P8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neil2Q6R2P8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Neil2Q6R2P8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neil2Q6R2P8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Neil2Q6R2P8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Neil2Q6R2P8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Neil2Q6R2P8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Neil2Q6R2P8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Neil2Q6R2P8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Neil2Q6R2P8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Neil2Q6R2P8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Neil2Q6R2P8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Neil2Q6R2P8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Neil2Q6R2P8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Neil2Q6R2P8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Neil2Q6R2P8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Neil2Q6R2P8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Neil2Q6R2P8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Neil2Q6R2P8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Neil2Q6R2P8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Neil2Q6R2P8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Neil2Q6R2P8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Neil2Q6R2P8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Neil2Q6R2P8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms