Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM8

Slc46a1, Proton-coupled folate transporter, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a1Q6PEM8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc46a1Q6PEM8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc46a1Q6PEM8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc46a1Q6PEM8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc46a1Q6PEM8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc46a1Q6PEM8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc46a1Q6PEM8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc46a1Q6PEM8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc46a1Q6PEM8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc46a1Q6PEM8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc46a1Q6PEM8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc46a1Q6PEM8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc46a1Q6PEM8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc46a1Q6PEM8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc46a1Q6PEM8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc46a1Q6PEM8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc46a1Q6PEM8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc46a1Q6PEM8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc46a1Q6PEM8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc46a1Q6PEM8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc46a1Q6PEM8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc46a1Q6PEM8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc46a1Q6PEM8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc46a1Q6PEM8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc46a1Q6PEM8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc46a1Q6PEM8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc46a1Q6PEM8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc46a1Q6PEM8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc46a1Q6PEM8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc46a1Q6PEM8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc46a1Q6PEM8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc46a1Q6PEM8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc46a1Q6PEM8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc46a1Q6PEM8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc46a1Q6PEM8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc46a1Q6PEM8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc46a1Q6PEM8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc46a1Q6PEM8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc46a1Q6PEM8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc46a1Q6PEM8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc46a1Q6PEM8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc46a1Q6PEM8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc46a1Q6PEM8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc46a1Q6PEM8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc46a1Q6PEM8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc46a1Q6PEM8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc46a1Q6PEM8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc46a1Q6PEM8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc46a1Q6PEM8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc46a1Q6PEM8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc46a1Q6PEM8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc46a1Q6PEM8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc46a1Q6PEM8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc46a1Q6PEM8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc46a1Q6PEM8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc46a1Q6PEM8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc46a1Q6PEM8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc46a1Q6PEM8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc46a1Q6PEM8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc46a1Q6PEM8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc46a1Q6PEM8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc46a1Q6PEM8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc46a1Q6PEM8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc46a1Q6PEM8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc46a1Q6PEM8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc46a1Q6PEM8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc46a1Q6PEM8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc46a1Q6PEM8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc46a1Q6PEM8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc46a1Q6PEM8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc46a1Q6PEM8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc46a1Q6PEM8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Slc46a1Q6PEM8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Slc46a1Q6PEM8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Slc46a1Q6PEM8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc46a1Q6PEM8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc46a1Q6PEM8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc46a1Q6PEM8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc46a1Q6PEM8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc46a1Q6PEM8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc46a1Q6PEM8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc46a1Q6PEM8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc46a1Q6PEM8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc46a1Q6PEM8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc46a1Q6PEM8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc46a1Q6PEM8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc46a1Q6PEM8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc46a1Q6PEM8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc46a1Q6PEM8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc46a1Q6PEM8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc46a1Q6PEM8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc46a1Q6PEM8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc46a1Q6PEM8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc46a1Q6PEM8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc46a1Q6PEM8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc46a1Q6PEM8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc46a1Q6PEM8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc46a1Q6PEM8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc46a1Q6PEM8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc46a1Q6PEM8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms