Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc85bQ6PDY0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc85bQ6PDY0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc85bQ6PDY0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc85bQ6PDY0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc85bQ6PDY0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc85bQ6PDY0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc85bQ6PDY0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc85bQ6PDY0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc85bQ6PDY0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc85bQ6PDY0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc85bQ6PDY0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc85bQ6PDY0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc85bQ6PDY0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc85bQ6PDY0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc85bQ6PDY0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc85bQ6PDY0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc85bQ6PDY0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc85bQ6PDY0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc85bQ6PDY0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc85bQ6PDY0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc85bQ6PDY0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc85bQ6PDY0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc85bQ6PDY0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc85bQ6PDY0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc85bQ6PDY0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc85bQ6PDY0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc85bQ6PDY0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc85bQ6PDY0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc85bQ6PDY0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc85bQ6PDY0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc85bQ6PDY0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc85bQ6PDY0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc85bQ6PDY0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc85bQ6PDY0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc85bQ6PDY0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc85bQ6PDY0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc85bQ6PDY0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc85bQ6PDY0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc85bQ6PDY0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc85bQ6PDY0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc85bQ6PDY0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc85bQ6PDY0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc85bQ6PDY0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc85bQ6PDY0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc85bQ6PDY0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc85bQ6PDY0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc85bQ6PDY0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc85bQ6PDY0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc85bQ6PDY0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc85bQ6PDY0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc85bQ6PDY0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc85bQ6PDY0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc85bQ6PDY0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc85bQ6PDY0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc85bQ6PDY0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc85bQ6PDY0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc85bQ6PDY0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc85bQ6PDY0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc85bQ6PDY0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc85bQ6PDY0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc85bQ6PDY0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc85bQ6PDY0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc85bQ6PDY0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc85bQ6PDY0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc85bQ6PDY0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc85bQ6PDY0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc85bQ6PDY0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc85bQ6PDY0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc85bQ6PDY0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc85bQ6PDY0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc85bQ6PDY0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccdc85bQ6PDY0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc85bQ6PDY0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc85bQ6PDY0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc85bQ6PDY0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc85bQ6PDY0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc85bQ6PDY0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc85bQ6PDY0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc85bQ6PDY0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc85bQ6PDY0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc85bQ6PDY0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc85bQ6PDY0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc85bQ6PDY0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc85bQ6PDY0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc85bQ6PDY0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc85bQ6PDY0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc85bQ6PDY0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc85bQ6PDY0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc85bQ6PDY0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms