Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1

Atmin, ATM interactor, mousemouse

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Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtminQ6P9S1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AtminQ6P9S1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AtminQ6P9S1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AtminQ6P9S1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AtminQ6P9S1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AtminQ6P9S1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
AtminQ6P9S1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
AtminQ6P9S1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
AtminQ6P9S1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AtminQ6P9S1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AtminQ6P9S1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AtminQ6P9S1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AtminQ6P9S1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AtminQ6P9S1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AtminQ6P9S1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AtminQ6P9S1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AtminQ6P9S1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AtminQ6P9S1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AtminQ6P9S1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AtminQ6P9S1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AtminQ6P9S1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AtminQ6P9S1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AtminQ6P9S1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
AtminQ6P9S1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AtminQ6P9S1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AtminQ6P9S1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AtminQ6P9S1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AtminQ6P9S1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AtminQ6P9S1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AtminQ6P9S1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AtminQ6P9S1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AtminQ6P9S1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
AtminQ6P9S1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AtminQ6P9S1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AtminQ6P9S1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AtminQ6P9S1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AtminQ6P9S1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AtminQ6P9S1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AtminQ6P9S1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AtminQ6P9S1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AtminQ6P9S1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AtminQ6P9S1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AtminQ6P9S1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AtminQ6P9S1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AtminQ6P9S1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AtminQ6P9S1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AtminQ6P9S1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AtminQ6P9S1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AtminQ6P9S1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AtminQ6P9S1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AtminQ6P9S1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AtminQ6P9S1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AtminQ6P9S1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AtminQ6P9S1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
AtminQ6P9S1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AtminQ6P9S1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AtminQ6P9S1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AtminQ6P9S1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AtminQ6P9S1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AtminQ6P9S1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AtminQ6P9S1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AtminQ6P9S1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AtminQ6P9S1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AtminQ6P9S1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AtminQ6P9S1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
AtminQ6P9S1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AtminQ6P9S1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AtminQ6P9S1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
AtminQ6P9S1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AtminQ6P9S1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AtminQ6P9S1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AtminQ6P9S1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AtminQ6P9S1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AtminQ6P9S1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
AtminQ6P9S1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AtminQ6P9S1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AtminQ6P9S1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AtminQ6P9S1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AtminQ6P9S1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AtminQ6P9S1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AtminQ6P9S1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AtminQ6P9S1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AtminQ6P9S1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
AtminQ6P9S1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AtminQ6P9S1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AtminQ6P9S1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AtminQ6P9S1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AtminQ6P9S1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
AtminQ6P9S1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AtminQ6P9S1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AtminQ6P9S1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AtminQ6P9S1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AtminQ6P9S1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AtminQ6P9S1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AtminQ6P9S1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AtminQ6P9S1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AtminQ6P9S1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AtminQ6P9S1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AtminQ6P9S1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AtminQ6P9S1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms