Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rrp12Q6P5B0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rrp12Q6P5B0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rrp12Q6P5B0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rrp12Q6P5B0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rrp12Q6P5B0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rrp12Q6P5B0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rrp12Q6P5B0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rrp12Q6P5B0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rrp12Q6P5B0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rrp12Q6P5B0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rrp12Q6P5B0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rrp12Q6P5B0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Rrp12Q6P5B0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rrp12Q6P5B0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rrp12Q6P5B0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rrp12Q6P5B0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rrp12Q6P5B0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rrp12Q6P5B0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rrp12Q6P5B0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rrp12Q6P5B0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rrp12Q6P5B0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rrp12Q6P5B0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rrp12Q6P5B0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rrp12Q6P5B0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rrp12Q6P5B0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rrp12Q6P5B0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rrp12Q6P5B0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rrp12Q6P5B0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rrp12Q6P5B0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rrp12Q6P5B0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rrp12Q6P5B0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rrp12Q6P5B0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rrp12Q6P5B0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rrp12Q6P5B0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rrp12Q6P5B0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rrp12Q6P5B0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rrp12Q6P5B0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rrp12Q6P5B0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rrp12Q6P5B0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rrp12Q6P5B0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rrp12Q6P5B0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rrp12Q6P5B0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rrp12Q6P5B0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rrp12Q6P5B0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rrp12Q6P5B0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rrp12Q6P5B0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rrp12Q6P5B0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rrp12Q6P5B0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rrp12Q6P5B0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Rrp12Q6P5B0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rrp12Q6P5B0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Rrp12Q6P5B0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rrp12Q6P5B0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rrp12Q6P5B0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rrp12Q6P5B0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Rrp12Q6P5B0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rrp12Q6P5B0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rrp12Q6P5B0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rrp12Q6P5B0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rrp12Q6P5B0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rrp12Q6P5B0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rrp12Q6P5B0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rrp12Q6P5B0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rrp12Q6P5B0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rrp12Q6P5B0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rrp12Q6P5B0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rrp12Q6P5B0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rrp12Q6P5B0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rrp12Q6P5B0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rrp12Q6P5B0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rrp12Q6P5B0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rrp12Q6P5B0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rrp12Q6P5B0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rrp12Q6P5B0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rrp12Q6P5B0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rrp12Q6P5B0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rrp12Q6P5B0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rrp12Q6P5B0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rrp12Q6P5B0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rrp12Q6P5B0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rrp12Q6P5B0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rrp12Q6P5B0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rrp12Q6P5B0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rrp12Q6P5B0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rrp12Q6P5B0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rrp12Q6P5B0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rrp12Q6P5B0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rrp12Q6P5B0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rrp12Q6P5B0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rrp12Q6P5B0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rrp12Q6P5B0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rrp12Q6P5B0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Rrp12Q6P5B0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rrp12Q6P5B0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rrp12Q6P5B0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rrp12Q6P5B0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rrp12Q6P5B0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rrp12Q6P5B0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rrp12Q6P5B0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 949.5 ms