Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZN1

Pprc1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pprc1Q6NZN1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Pprc1Q6NZN1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Pprc1Q6NZN1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
Pprc1Q6NZN1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
Pprc1Q6NZN1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Pprc1Q6NZN1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Pprc1Q6NZN1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Pprc1Q6NZN1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Pprc1Q6NZN1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
Pprc1Q6NZN1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Pprc1Q6NZN1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
Pprc1Q6NZN1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Pprc1Q6NZN1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC39.47■■■■□ 3.91
Pprc1Q6NZN1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
Pprc1Q6NZN1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC39.46■■■■□ 3.91
Pprc1Q6NZN1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Pprc1Q6NZN1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Pprc1Q6NZN1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Pprc1Q6NZN1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
Pprc1Q6NZN1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Pprc1Q6NZN1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
Pprc1Q6NZN1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Pprc1Q6NZN1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC39.36■■■■□ 3.89
Pprc1Q6NZN1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Pprc1Q6NZN1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
Pprc1Q6NZN1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Pprc1Q6NZN1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Pprc1Q6NZN1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC39.33■■■■□ 3.89
Pprc1Q6NZN1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Pprc1Q6NZN1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC39.32■■■■□ 3.88
Pprc1Q6NZN1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
Pprc1Q6NZN1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Pprc1Q6NZN1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC39.3■■■■□ 3.88
Pprc1Q6NZN1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
Pprc1Q6NZN1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Pprc1Q6NZN1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Pprc1Q6NZN1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC39.26■■■■□ 3.88
Pprc1Q6NZN1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Pprc1Q6NZN1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Pprc1Q6NZN1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Pprc1Q6NZN1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
Pprc1Q6NZN1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Pprc1Q6NZN1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Pprc1Q6NZN1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
Pprc1Q6NZN1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Pprc1Q6NZN1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Pprc1Q6NZN1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Pprc1Q6NZN1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Pprc1Q6NZN1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
Pprc1Q6NZN1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
Pprc1Q6NZN1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
Pprc1Q6NZN1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
Pprc1Q6NZN1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Pprc1Q6NZN1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Pprc1Q6NZN1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Pprc1Q6NZN1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Pprc1Q6NZN1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
Pprc1Q6NZN1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.85
Pprc1Q6NZN1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Pprc1Q6NZN1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
Pprc1Q6NZN1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
Pprc1Q6NZN1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
Pprc1Q6NZN1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
Pprc1Q6NZN1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Pprc1Q6NZN1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Pprc1Q6NZN1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Pprc1Q6NZN1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Pprc1Q6NZN1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
Pprc1Q6NZN1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Pprc1Q6NZN1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Pprc1Q6NZN1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Pprc1Q6NZN1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC39■■■■□ 3.83
Pprc1Q6NZN1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC39■■■■□ 3.83
Pprc1Q6NZN1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
Pprc1Q6NZN1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Pprc1Q6NZN1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Pprc1Q6NZN1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Pprc1Q6NZN1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Pprc1Q6NZN1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Pprc1Q6NZN1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Pprc1Q6NZN1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Pprc1Q6NZN1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Pprc1Q6NZN1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Pprc1Q6NZN1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Pprc1Q6NZN1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC38.9■■■■□ 3.82
Pprc1Q6NZN1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Pprc1Q6NZN1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
Pprc1Q6NZN1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Pprc1Q6NZN1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Pprc1Q6NZN1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Pprc1Q6NZN1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Pprc1Q6NZN1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC38.85■■■■□ 3.81
Pprc1Q6NZN1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Pprc1Q6NZN1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Pprc1Q6NZN1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Pprc1Q6NZN1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Pprc1Q6NZN1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.81
Pprc1Q6NZN1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
Pprc1Q6NZN1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Pprc1Q6NZN1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms