Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ParpbpQ6IRT3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ParpbpQ6IRT3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ParpbpQ6IRT3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ParpbpQ6IRT3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ParpbpQ6IRT3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ParpbpQ6IRT3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ParpbpQ6IRT3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ParpbpQ6IRT3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ParpbpQ6IRT3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ParpbpQ6IRT3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ParpbpQ6IRT3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ParpbpQ6IRT3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ParpbpQ6IRT3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ParpbpQ6IRT3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ParpbpQ6IRT3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ParpbpQ6IRT3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ParpbpQ6IRT3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ParpbpQ6IRT3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ParpbpQ6IRT3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ParpbpQ6IRT3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ParpbpQ6IRT3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ParpbpQ6IRT3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ParpbpQ6IRT3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ParpbpQ6IRT3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ParpbpQ6IRT3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ParpbpQ6IRT3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ParpbpQ6IRT3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ParpbpQ6IRT3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ParpbpQ6IRT3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ParpbpQ6IRT3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ParpbpQ6IRT3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ParpbpQ6IRT3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ParpbpQ6IRT3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ParpbpQ6IRT3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ParpbpQ6IRT3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ParpbpQ6IRT3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ParpbpQ6IRT3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ParpbpQ6IRT3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ParpbpQ6IRT3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ParpbpQ6IRT3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ParpbpQ6IRT3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ParpbpQ6IRT3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ParpbpQ6IRT3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ParpbpQ6IRT3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ParpbpQ6IRT3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ParpbpQ6IRT3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ParpbpQ6IRT3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ParpbpQ6IRT3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ParpbpQ6IRT3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ParpbpQ6IRT3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ParpbpQ6IRT3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ParpbpQ6IRT3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ParpbpQ6IRT3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ParpbpQ6IRT3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ParpbpQ6IRT3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ParpbpQ6IRT3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ParpbpQ6IRT3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ParpbpQ6IRT3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ParpbpQ6IRT3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ParpbpQ6IRT3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ParpbpQ6IRT3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ParpbpQ6IRT3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ParpbpQ6IRT3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ParpbpQ6IRT3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ParpbpQ6IRT3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ParpbpQ6IRT3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ParpbpQ6IRT3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ParpbpQ6IRT3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ParpbpQ6IRT3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ParpbpQ6IRT3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ParpbpQ6IRT3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ParpbpQ6IRT3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ParpbpQ6IRT3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ParpbpQ6IRT3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ParpbpQ6IRT3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ParpbpQ6IRT3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ParpbpQ6IRT3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ParpbpQ6IRT3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ParpbpQ6IRT3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ParpbpQ6IRT3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ParpbpQ6IRT3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ParpbpQ6IRT3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ParpbpQ6IRT3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ParpbpQ6IRT3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ParpbpQ6IRT3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ParpbpQ6IRT3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ParpbpQ6IRT3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ParpbpQ6IRT3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ParpbpQ6IRT3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ParpbpQ6IRT3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ParpbpQ6IRT3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ParpbpQ6IRT3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ParpbpQ6IRT3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ParpbpQ6IRT3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ParpbpQ6IRT3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ParpbpQ6IRT3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ParpbpQ6IRT3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ParpbpQ6IRT3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ParpbpQ6IRT3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms