Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Hecw2Q6I6G8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Hecw2Q6I6G8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Hecw2Q6I6G8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Hecw2Q6I6G8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Hecw2Q6I6G8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Hecw2Q6I6G8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Hecw2Q6I6G8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Hecw2Q6I6G8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Hecw2Q6I6G8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Hecw2Q6I6G8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Hecw2Q6I6G8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Hecw2Q6I6G8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Hecw2Q6I6G8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
Hecw2Q6I6G8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Hecw2Q6I6G8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Hecw2Q6I6G8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Hecw2Q6I6G8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Hecw2Q6I6G8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Hecw2Q6I6G8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Hecw2Q6I6G8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Hecw2Q6I6G8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Hecw2Q6I6G8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Hecw2Q6I6G8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Hecw2Q6I6G8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Hecw2Q6I6G8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Hecw2Q6I6G8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
Hecw2Q6I6G8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Hecw2Q6I6G8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Hecw2Q6I6G8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Hecw2Q6I6G8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Hecw2Q6I6G8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Hecw2Q6I6G8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Hecw2Q6I6G8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Hecw2Q6I6G8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Hecw2Q6I6G8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Hecw2Q6I6G8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Hecw2Q6I6G8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Hecw2Q6I6G8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Hecw2Q6I6G8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Hecw2Q6I6G8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Hecw2Q6I6G8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Hecw2Q6I6G8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Hecw2Q6I6G8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Hecw2Q6I6G8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Hecw2Q6I6G8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Hecw2Q6I6G8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Hecw2Q6I6G8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Hecw2Q6I6G8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Hecw2Q6I6G8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Hecw2Q6I6G8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Hecw2Q6I6G8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Hecw2Q6I6G8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Hecw2Q6I6G8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Hecw2Q6I6G8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Hecw2Q6I6G8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Hecw2Q6I6G8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Hecw2Q6I6G8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Hecw2Q6I6G8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Hecw2Q6I6G8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Hecw2Q6I6G8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Hecw2Q6I6G8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Hecw2Q6I6G8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Hecw2Q6I6G8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Hecw2Q6I6G8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Hecw2Q6I6G8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Hecw2Q6I6G8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Hecw2Q6I6G8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Hecw2Q6I6G8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Hecw2Q6I6G8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Hecw2Q6I6G8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Hecw2Q6I6G8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Hecw2Q6I6G8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Hecw2Q6I6G8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Hecw2Q6I6G8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Hecw2Q6I6G8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Hecw2Q6I6G8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Hecw2Q6I6G8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
Hecw2Q6I6G8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Hecw2Q6I6G8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Hecw2Q6I6G8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Hecw2Q6I6G8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Hecw2Q6I6G8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Hecw2Q6I6G8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Hecw2Q6I6G8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Hecw2Q6I6G8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Hecw2Q6I6G8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Hecw2Q6I6G8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Hecw2Q6I6G8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Hecw2Q6I6G8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Hecw2Q6I6G8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Hecw2Q6I6G8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Hecw2Q6I6G8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Hecw2Q6I6G8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Hecw2Q6I6G8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Hecw2Q6I6G8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Hecw2Q6I6G8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Hecw2Q6I6G8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Hecw2Q6I6G8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Hecw2Q6I6G8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms