Protein–RNA interactions for Protein: Q64FW2

Retsat, All-trans-retinol 13,14-reductase, mousemouse

Predictions only

Length 609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetsatQ64FW2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RetsatQ64FW2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RetsatQ64FW2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RetsatQ64FW2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RetsatQ64FW2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RetsatQ64FW2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RetsatQ64FW2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RetsatQ64FW2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RetsatQ64FW2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RetsatQ64FW2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RetsatQ64FW2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RetsatQ64FW2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RetsatQ64FW2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RetsatQ64FW2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RetsatQ64FW2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RetsatQ64FW2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RetsatQ64FW2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RetsatQ64FW2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RetsatQ64FW2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RetsatQ64FW2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RetsatQ64FW2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RetsatQ64FW2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RetsatQ64FW2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RetsatQ64FW2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RetsatQ64FW2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RetsatQ64FW2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RetsatQ64FW2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RetsatQ64FW2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RetsatQ64FW2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RetsatQ64FW2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RetsatQ64FW2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RetsatQ64FW2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RetsatQ64FW2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RetsatQ64FW2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RetsatQ64FW2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RetsatQ64FW2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RetsatQ64FW2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
RetsatQ64FW2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RetsatQ64FW2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RetsatQ64FW2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RetsatQ64FW2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RetsatQ64FW2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RetsatQ64FW2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RetsatQ64FW2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RetsatQ64FW2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RetsatQ64FW2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RetsatQ64FW2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RetsatQ64FW2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RetsatQ64FW2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RetsatQ64FW2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RetsatQ64FW2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RetsatQ64FW2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RetsatQ64FW2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RetsatQ64FW2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RetsatQ64FW2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RetsatQ64FW2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RetsatQ64FW2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RetsatQ64FW2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RetsatQ64FW2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RetsatQ64FW2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RetsatQ64FW2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RetsatQ64FW2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RetsatQ64FW2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RetsatQ64FW2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RetsatQ64FW2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RetsatQ64FW2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RetsatQ64FW2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RetsatQ64FW2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RetsatQ64FW2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RetsatQ64FW2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RetsatQ64FW2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RetsatQ64FW2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RetsatQ64FW2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RetsatQ64FW2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RetsatQ64FW2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RetsatQ64FW2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RetsatQ64FW2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RetsatQ64FW2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RetsatQ64FW2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RetsatQ64FW2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RetsatQ64FW2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RetsatQ64FW2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RetsatQ64FW2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RetsatQ64FW2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RetsatQ64FW2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RetsatQ64FW2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RetsatQ64FW2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RetsatQ64FW2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RetsatQ64FW2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RetsatQ64FW2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RetsatQ64FW2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RetsatQ64FW2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RetsatQ64FW2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RetsatQ64FW2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RetsatQ64FW2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RetsatQ64FW2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RetsatQ64FW2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RetsatQ64FW2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RetsatQ64FW2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RetsatQ64FW2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms