Protein–RNA interactions for Protein: Q64512

Ptpn13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn13Q64512 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptpn13Q64512 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptpn13Q64512 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptpn13Q64512 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptpn13Q64512 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptpn13Q64512 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptpn13Q64512 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptpn13Q64512 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptpn13Q64512 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpn13Q64512 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpn13Q64512 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpn13Q64512 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpn13Q64512 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpn13Q64512 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpn13Q64512 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpn13Q64512 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpn13Q64512 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn13Q64512 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn13Q64512 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn13Q64512 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn13Q64512 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn13Q64512 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn13Q64512 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn13Q64512 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn13Q64512 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptpn13Q64512 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn13Q64512 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn13Q64512 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn13Q64512 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn13Q64512 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn13Q64512 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn13Q64512 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn13Q64512 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn13Q64512 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn13Q64512 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpn13Q64512 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn13Q64512 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn13Q64512 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn13Q64512 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ptpn13Q64512 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ptpn13Q64512 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn13Q64512 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn13Q64512 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn13Q64512 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn13Q64512 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpn13Q64512 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpn13Q64512 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptpn13Q64512 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptpn13Q64512 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ptpn13Q64512 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ptpn13Q64512 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ptpn13Q64512 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptpn13Q64512 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpn13Q64512 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpn13Q64512 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptpn13Q64512 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptpn13Q64512 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptpn13Q64512 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpn13Q64512 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn13Q64512 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn13Q64512 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn13Q64512 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn13Q64512 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn13Q64512 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn13Q64512 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn13Q64512 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpn13Q64512 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpn13Q64512 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpn13Q64512 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpn13Q64512 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpn13Q64512 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn13Q64512 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn13Q64512 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn13Q64512 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpn13Q64512 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms