Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Gja3Q64448 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Gja3Q64448 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Gja3Q64448 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Gja3Q64448 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Gja3Q64448 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Gja3Q64448 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Gja3Q64448 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Gja3Q64448 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Gja3Q64448 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Gja3Q64448 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Gja3Q64448 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Gja3Q64448 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Gja3Q64448 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Gja3Q64448 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Gja3Q64448 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Gja3Q64448 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Gja3Q64448 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Gja3Q64448 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Gja3Q64448 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Gja3Q64448 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Gja3Q64448 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gja3Q64448 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gja3Q64448 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Gja3Q64448 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Gja3Q64448 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Gja3Q64448 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Gja3Q64448 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Gja3Q64448 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Gja3Q64448 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gja3Q64448 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gja3Q64448 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gja3Q64448 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Gja3Q64448 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gja3Q64448 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Gja3Q64448 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Gja3Q64448 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gja3Q64448 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gja3Q64448 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gja3Q64448 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gja3Q64448 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Gja3Q64448 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Gja3Q64448 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Gja3Q64448 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gja3Q64448 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gja3Q64448 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gja3Q64448 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gja3Q64448 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gja3Q64448 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gja3Q64448 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gja3Q64448 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gja3Q64448 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gja3Q64448 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gja3Q64448 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Gja3Q64448 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Gja3Q64448 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gja3Q64448 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gja3Q64448 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Gja3Q64448 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Gja3Q64448 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gja3Q64448 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gja3Q64448 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gja3Q64448 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gja3Q64448 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gja3Q64448 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gja3Q64448 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Gja3Q64448 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Gja3Q64448 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Gja3Q64448 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Gja3Q64448 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gja3Q64448 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gja3Q64448 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Gja3Q64448 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gja3Q64448 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gja3Q64448 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gja3Q64448 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gja3Q64448 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gja3Q64448 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gja3Q64448 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Gja3Q64448 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gja3Q64448 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Gja3Q64448 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gja3Q64448 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Gja3Q64448 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gja3Q64448 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gja3Q64448 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gja3Q64448 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Gja3Q64448 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gja3Q64448 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Gja3Q64448 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Gja3Q64448 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gja3Q64448 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gja3Q64448 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gja3Q64448 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gja3Q64448 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gja3Q64448 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gja3Q64448 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gja3Q64448 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Gja3Q64448 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Gja3Q64448 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms